- Гидробиологическая станция «Глубокое озеро» им. Н.Ю. Зографа
- Биогеоценологическая станция «Малинки»
- Научно-экспериментальная база «Черноголовка»
- Плавучая экспериментальная база
- Южно-Валдайская экологическая обсерватория «Оковский лес»
- Костромская таежная научно-опытная станция
- Енисейская экологическая станция
- Утришская морская станция