Общее направление работы – изучение экологических, поведенческих, физиологических и генетических факторов и механизмов динамики популяций и сообществ как основы их устойчивости и изменчивости при изменении условий среды на модели мелких млекопитающих и воробьиных птиц. Методологические подходы основаны на долговременных комплексных мониторинговых и индивидуально-ориентированных исследованиях пространственной и временной динамики природных популяций в меняющихся условиях различных ландшафтных зон в сочетании с лабораторными и экспериментальными исследованиями. Методология строится на использовании комплекса зоологических, ботанических, этологических, экологических, физиологических, биохимических, молекулярно-генетических, цитогенетических и морфологических методов. Основные направления:
Долговременная динамика популяций и сообществ: роль изменения климата, антропогенной трансформации ландшафта, неоднородности среды и внутрипопуляционных механизмов
Нестационарная динамика популяций грызунов пастбищных экосистем при изменении пастбищных нагрузок и климата (Калмыкия, 1980- н.в.) (Е.Н. Суркова, Л.Е. Савинецкая, В.В. Неронов, А.В. Чабовский)
Динамика популяций и сообществ мелких млекопитающих Енисейской тайги: роль изменения климата, пространственной неоднородности среды и внутрипопуляционных факторов (1972 – н.в.) (Б.И. Шефтель)
Динамика популяций и сообществ воробьиных птиц енисейской тайги: роль видовой специализации, пространственной неоднородности и потепления климата (1978 – н.в.) (О.В. Бурский, Е.Ю. Демидова)
Динамика популяций мелких млекопитающих умеренных лесов Европейской части: роль пространственной неоднородности, антропогенной трансформации местообитаний и внутрипопуляционных механизмов (Тверская область, 2005 – н.в.) (Н.А. Щипанов, А.А. Калинин)
Динамика популяций и сообществ мелких млекопитающих северной тайги: роль физических и экологических факторов в ограничении и регуляции дисперсии. (Республика Коми, 2005 – н.в.) (А.А. Калинин)
Структура популяций лесных птиц в условиях естественной и антропогенной фрагментации лесного ландшафта на примере островного лесного массива в подзоне сухих степей Заволжья (О.Н. Батова)
Популяционные, экологические, морфологические, поведенческие, молекулярно-генетические, цитогенетические аспекты внутривидовой дифференциации и подразделенности
Происхождение и эволюция хромосомных рас обыкновенной бурозубки: цитогенетические, молекулярно-генетические, экологические, морфологические, этологические аспекты гибридизации, изоляции и распространения рас (Н.А. Щипанов, С.В. Павлова, Б.И. Шефтель).
Экологические, географические и генетические аспекты внутривидовой дифференциации длиннохвостого суслика (А.В. Чабовский, Л.Е. Савинецкая)
Эволюция жизненных циклов, репродуктивных стратегий и брачных отношений, механизмы полового отбора, выбор партнера и конфликт полов.
Жизненные циклы воробьиных птиц: разнообразие, экологическая обусловленность и демографические следствия – по материалам долговременных популяционных исследований в енисейской тайге (О.В. Бурский, Е.Ю. Демидова).
Эколого-физиологические основы популяционных процессов и эволюции жизненных циклов: трейдоффы жизненного цикла (конфликт между репродуктивным усилием и механизмами иммунной защиты организма), роль стресса в модификации онтогенетических программ. (К.А. Роговин, О.Н. Шекарова)
Экологические, поведенческие и молекулярно-генетические аспекты репродуктивных стратегий, брачных отношений и отцовства у варакушки: долговременные индивидуально-ориентированные исследования природной популяции в Заволжье (О.Н. Батова).
Репродуктивные стратегии, репродуктивные решения и жизненные циклы наземных беличьих: эволюционные и экологические аспекты – долговременные индивидуально-ориентированные исследования природной популяции желтого суслика в Заволжье (Н.А. Васильева, А.В. Чабовский).
Экологические аспекты эволюция паразитарных систем на примере чумы (В.В. Сунцов)
Состояние и динамика редких видов грызунов – природоохранные аспекты (О.Н. Шекарова, Л.Е. Савинецкая)