Началом изучения паразитов растений, в частности, фитонематод в Гельминтологической лаборатории АН СССР (ГЕЛАН, ныне - Центр паразитологии ИПЭЭ РАН) следует считать апрель 1952 года, связанный с приходом в Лабораторию профессора А.А. Парамонова. Академик К.И.Скрябин, в возглавляемой им Лаборатории, предложил А.А.Парамонову заняться проблемами паразитизма круглых червей на растениях. К этому времени в мировом научном сообществе было накоплено много данных о нематодах, встречающихся на растениях, однако как теоретическое, так и прикладное значение этих фактов еще не было в достаточной мере проанализировано. Существовали лишь предпосылки для развития фитонематологии как науки. Это привело к необходимости начать широкомасштабные фаунистические исследования нематод сельскохозяйственных и дикорастущих растений в различных почвенно-климатических районах Европейской и Азиатской частей бывшего Советского Союза. Для выполнения этой работы А.А.Парамоновым были привлечены стажеры и аспиранты из всех республик страны. Параллельно с изучением фауны и таксономии фитонематод были начаты исследования их экологии, биологии размножения и питания, морфологии и онтогенеза, взаимосвязи с другими членами биоценоза (грибами, бактериями), специфики вызываемых ими болезней растений-хозяев, основной целью которых был поиск путей терапии растений при фитогельминтозах. Материалы, полученные в результате этих исследований первыми фитонематологами и аспирантами ГЕЛАНа из различных регионов страны (Турлыгиной Е.С., Мюге С.А., Крыловым П.С., Барановской И.А., Судаковой И.М., Даманской Л.Ю. И.А., Покровской Т.В Элиавой И.Я., Шлепетене Ю.А., Балбаевой З., Скуодите З., Соловьевой Г.И. Ерошенко А.С. и др.), послужили фундаментом для разработки А.А. Парамоновым понятия о фитогельминтологии, как о самостоятельной научной дисциплине, которая имеет своеобразные объекты исследования, методологию, задачи и пути развития. Всё это было отражено в трехтомной монографии А.А.Парамонова «Основы фитогельминтологии» (1962, 1964, 1970), в которой изложены основные концепции новой науки, которые не утратили своего значения до сих пор. Таковыми являются: экологическая классификация почвообитающих нематод, основанная на формах их отношений с растениями; классификация жизненных циклов фитогельминтов, учитывающая степень связи различных этапов их развития, как с растением, так и с почвой; микотрофная гипотеза происхождения фитопаразитизма тиленхид, опирающаяся на древнейшие связи нематод с грибами; представление о фитогельминтозах как о биоценотических процессах, в которых, помимо их возбудителей (фитогельминтов), участвуют также сапробиотические нематоды, грибы, бактерии; положение о защитных свойствах растений от нематод и терапии их при фитогельминтозах и ряд других. Монография была переведена на английский язык и явилась основополагающей для развития фитогельминтологии не только у нас в стране, но и во всем мире. В 1962 году было создано самостоятельное подразделение - Кабинет фитогельминтологии, который в 1965 году был преобразован в Сектор фитогельминтологии, возглавляемый профессором А.А.Парамоновым. После кончины А.А.Парамонова в 1970 году Сектор фитогельминтологии возглавила его ученица Е.С. Турлыгина, которая оставалась его руководителем до 1986 года. В этот период исследования проводились преимущественно в двух направлениях: изучение факторов формирования фаунистических комплексов фитонематод в естественных и агро- ценозах и изучение взаимоотношений фитопаразитических нематод с растениями-хозяевами. Ведущими специалистами по первому направлению исследований в этот период были И.А. Барановская, В.Г. Гагарин, В.Г. Губина, Л.В. Павлюк, Т.М. Покровская, Н.И. Суменкова, Л.В. Шубина. Методологически эти работы могут быть оценены как "экспериментальная фаунистика", поскольку большинство их проведено в условиях полевых опытов с использованием различных методов статистического анализа. Все эти работы нашли свое отражение в ряде монографий (три монографии в серии "Нематоды растений и почвы", посвященные Неотиленхоидеям (Суменкова,1975), Афеленхоидидам и Сейнуридам (Барановская, 1981), роду Дитиленхус (коллектив авторов, 1982)), а также монографии по нематодам хвойных пород (Губина, 1980) и по мелойдогинозу и борьбе с галловыми нематодами (Покровская, 1988). Многие из этих работ переведены на английский язык, изданы за рубежом. Второе направление, осуществляемое, Е.С.Турлыгиной, ее диссертантки С.В. Зиновьевой и Н.А. Костюк предусматривало преимущественно экспериментальные исследования онтогенеза нематод, биологии их размножения и критериев устойчивости растений к фитогельминтам. Результаты этих работ нашли свое отражение в докторской диссертации Н.А. Костюк, в которой впервые освещены проблемы эмбрионального и постэмбрионального развития широкого спектра таксонов фитонематод; в монографической сводке Е.С. Турлыгиной и В.Н. Чижова, 1991, посвященной обобщению многолетних исследований морфологии, биологии размножения и эволюции половой системы фитонематод, а также в работах С.В. Зиновьевой, которые были направлены на разработку на тот момент совершенно нового направления фитогельминтологии - иммунитета растений к фитогельминтам. На основе этих данных разработана гипотеза становления иммунитета растений к паразитическим нематодам, связанного с эволюцией паразитизма у фитонематод. В последние 20 лет традиционные таксономические и экологические исследования фитонематод, вследствие внедрения биохимических и молекулярных методов, вышли на субвидовой (популяционный) и субпопуляционный уровни. Получило развитие такое направление исследований, как лесная нематология (д.б.н. О.А. Кулинич). Возобновились фаунистические исследования фитонематод различных ресурсных видов растений (к.б.н. В.Н. Чижов). Изучение взаимоотношений между различными фитопаразитическими организмами, составляющими единый патокомплекс в фитоценозе вылилось в отдельное направление - ценологию фитопаразитов (д.б.н. Н.Д. Романенко). С 1989 года по 1995 гг. руководителем лаборатории стал ученик А.А. Парамонова, д.б.н. Н.Д. Романенко, приглашенный из Института садоводства Нечерноземной полосы РСФСР, а с 1995 года руководство осуществлял директор института, чл.- корр. РАН М.Д. Сонин. После ухода М.Д. Сонина на пенсию, в 2001 году фитопаразитологические исследования в институте возглавила ученица Е.С. Турлыгиной, д.б.н. С.В. Зиновьева. В эти годы активно начали развиваться такие направления исследований, как разработка прогностических моделей динамики численности, вредоносности и хозяйственного ущерба, причиняемого популяциями фитопаразитических нематод (д.б.н., К.А. Перевертин); создание компьютерных баз данных по фитонематодам, зарегистрированным в коллекции Лаборатории. Для хранения и удобного пользования накопленной информации по фитонематодам были созданы: атлас - справочные пособия по таксономии фитонематод, включающие в настоящее время данные о 7 тысячах видов почвообитающих и фитопаразитических нематод, относящихся к 682 родам; коллекция постоянных препаратов фитонематод, которая содержит 3,5 тысячи зарегистрированных предметных стекол, включающих более 10 тысяч особей, идентифицированных до видового уровня (500 видов, 144 из которых представлены типовыми экземплярами) или до таксонов более высокого ранга (род, семейство). Коллекция препаратов зарегистрирована в 1995г., как Национальная коллекция, принимающая на хранение типовые экземпляры. В настоящее время лабораторию возглавляет фитопатолог - к.б.н. Приданников М.В. Фаунистическое направление продолжают развивать к.б.н. Таболин С.Б. и Хусаинов Р.В. Большое внимание уделяется молекулярной таксономии и филогении фитопаразитических нематод, опубликовано несколько монографий и глав монографий (к.б.н. Субботин С.А). Биохимическими и молекулярными исследования в области иммунитета растений к нематодам занимаются д.б.н. Зиновьева С.В. и к.б.н. Удалова Ж.В. Ведутся исследования биологии и экологии карантинных видов нематод (д.б.н. Кулинич О.А., к.б.н. Козырева Н.Н.). Коллекцию нематод лаборатории поддерживают к.б.н. Буторина Н.Н. и Геннадиева Т.М. Международные связи лаборатории были достаточно широкими на протяжении всей ее истории. Сотрудники Лаборатории имели тесные контакты со специалистами Германии, Венгрии, работали на Кубе, принимали у себя аспирантов и стажеров из Болгарии, Чехословакии, Венгрии, Индии, Вьетнама, Кубы, Иордании, Съерра-Леоне, из всех республик бывшего Советского Союза. В последние годы эти связи стали расширяться и укрепляться преимущественно за счет международных грантов с Великобританией, Бельгией, Германией, Китаем.