Группа поведения и поведенческой экологии млекопитающих выделена в самостоятельное подразделение в 1998 г. при реорганизации лаборатории морфологии, экологии и поведения высших позвоночных, которой руководил академик В.Е. Соколов, а в 2006 году преобразована в лабораторию поведения и поведенческой экологии млекопитающих с присоединением к ней группы прикладной этологии наземных позвоночных.