Дгебуадзе Ю.Ю., Дулмаа А. Костные рыбы. // В кн.: Редкие животные Монголии (Позвоночные). 1996, М. ИПЭЭ РАН: с.7-39.
Dgebuadze Yu. Yu. The Land/inland-water ecotones and fish population of Lake Valley (West Mongolia). //Hydrobiologia, 1995, 303: 235-245.
Дгебуадзе Ю.Ю., Дулмаа А, Костные рыбы. //В кн.: Редкие животные Монголии (Позвоночные). под ред. В.Е.Соколова,1996, М. ИПЭЭ РАН:7-39.
Mina M.V., A.N.Mironovsky, Dgebuadze Y. Lake Tana large barbs: phenetics, growth and diversification. //Journal of Fish Biology. 1996, 48: 383-404.
Popova O.A., Yu.Yu. Reshetnikov, V.I.Kiyashko, Dgebuadze Yu. Yu. V.N.Mikheev Ruffe from the former USSR: variability within the largest part of its natural range. //J. Great Lakes Res. 1998, 24 (2): 263-284
Дгебуадзе Ю.Ю. Экологические закономерности изменчивости роста рыб. М.: Наука. 2001, 276 с.
Завьялов Н.А., Крылов А.В., Бобров А.А., Иванов В.К., Дгебуадзе Ю.Ю. Влияние речного бобра на экосистемы малых рек. М.Наука. 2005: 186 с.
Pavlov D.S., Mikheev V.N., Dgebuadze Yu.Yu. Behavioral Aspects of Biological Invasions of Alien Fish Species // Journal of Ichthyology. 2006, Vol. 46, Suppl. 2, pp. 117-124.
Дгебуадзе Ю.Ю., Фенева И.Ю., Будаев С.В., Роль хищничества и конкуренции в инвазионных процессах на примере зоопланктонных сообществ. Биология внутренних вод. 2006, 1, с. 67-73.
Panov V.E., Yu.Yu. Dgebuadze, T.A. Shiganova, A.A. Filippov, D.Minchin A risk assessment of biological invasions in the inland waterways of Europe: the Northern Invasion Corridor case study //in: Francesca Gherardi (ed.), Biological invaders in inland waters: Profiles, distribution, and threats, 2007 Springer. 639–656.
Dgebuadze Yu.Yu., V.I. Kiyashko, V.V. Osipov. 2008. Life-history variation in invasive populations of Caspian Кilka, Clupeonella cultriventris (Clupeidae, Pisces) in the Volga River Basin // In: Rabitsch, W., F. Essl & F. Кlingenstein (Eds.): Biological Invasions -from Ecology to Conservation. NEOBIOTА 7 (2008): 153-159.
Дгебуадзе Ю.Ю., Чернова О.Ф. Чешуя рыб как диагностическая и регистрирующая структура» М.: Тов. Научн. Изд. КМК. 2009. 315 с.+ 81 с. приложения.
Dgebuadze Yu.Yu., Fenieva I.Yu.., Stochastic and deterministic mechanisms structuring aquatic communities invaded by alien species // In: Pyšek, P. & Pergl, J. (Eds) (2009): Biological Invasions:Towards a Synthesis. Neobiota 8: 61-74
Дгебуадзе Ю.Ю., Прокофьев А.М., Слынько Ю.В., Эрдэнэбат М., Мэндсайхан Б. Рыбы бассейна р. Селенги // В кн. Водные экосистемы бассейна Селенги. 2009. М.: ИПЭЭ РАН. С.233-312.
Dgebuadze Yu.Yu., N.A. Zavyalov A preliminary study of the influence of beaver activity on fish assemblages of small low gradient streams in the Volga River basin // Restoring the European Beaver: 50 Years of experience” Pensoft 2011: 228-240.
Dgebuadze Yu. Yu. and Chernova O. F. Scale Structure Variability of “Forms Flock” of Barbus (=Labeobarbus) intermedius and Varicorhinus jubae from the Genale River (Eastern Ethiopia). Journal of Ichthyology, 2012, Vol. 52, No. 11, pp. 881–907.
Dgebuadze Yu.Yu. Central Asian Closed Basin: Unique place of cyclic diversification of fish // In: Ecosystems of Central Asia under current conditions of socio-economic development. Proceedings of the international conference. 2015, Ulaanbaatar, Mongolia. General and Experimental Biology MAS. V 2: 29-33.
Dgebuadze Yury Yu. Fishery and freshwater ecosystems of Russia: status, trends, research, management and priorities //In: Freshwater Fisheries Ecology” Wiley Blackwell. 2016. p. 120-133. https://books.google.ru/books?hl=ru&lr=&id=ppdmCwAAQBAJ&oi=fnd&pg=PA221&ots=-7lPuL
Дгебуадзе Ю.Ю., Н.Н. Сущик, И.В. Башинский, О.Н. Махутова, Г.С. Калачева, В.В. Осипов, М.И. Гладышев Анализ состава жирных кислот выявил различия в спектрах питания головастиков двух видов амфибий// Докл. Академии наук. 2017, том 472, № 3, с. 350–353.
Dgebuadze Yu.Yu., Bashinskiy I.V. Electrofishing method improves evaluation of amphibian larvae abundance: a case of “beaver rivers” // Integrative Zoology 2017; 12: 345–350. doi: 10.1111/1749-4877.12246.
Gladyshev M.I.,Nadezhda N. Sushchik, Olesia N. Makhutova, Larisa A. Glushchenko, Anastasia E. Rudchenko, Alexander A. Makhrov,·Elena A. Borovikova, Yury Y. Dgebuadze. Fatty Acid Composition and Contents of Seven Commercial Fish Species of Genus Coregonus from Russian Subarctic Water Bodies // Lipids (2017) 52:1033–1044 DOI 10.1007/s11745-017-4304-8.
Mendsaikhan, Yury Yu. Dgebuadze, Purevdorj Surenkhorloo.Guide book to Mongolian fishes. 2017. WWF, Mongolian Programme Ofice. Ulaanbaatar. Admon. 203 p.
Michail I. Gladyshev . Nadezhda N. Sushchik . Alexander P. Tolomeev . Yury Yu Dgebuadze. Meta-analysis of factors associated with omega-3 fatty acid contents of wild fish. Rev Fish Biol Fisheries (2018) 28:277–299. https://doi.org/10.1007/s11160-017-9511-0
Самые опасные инвазионные виды России (ТОП-100) / Ред. Дгебуадзе Ю.Ю., Петросян В.Г., Хляп Л.А. М.: Т-во научных изданий КМК, 2018. 688 с.
Мироновский А.Н., М. В. Мина, Ю. Ю. Дгебуадзе. Крупные африканские усачи с гипертрофированными губами и их отношения с генерализованными формами видов рода Barbus (LabeobarbusAUCTORUM) Вопросы ихтиологии, 2019, том 59, № 3, с. 269–276
Measey J, Visser V, Dgebuadze Y, Inderjit, Li B, Dechoum M, Silvia R. Ziller, David M. Richardson. (2019) The world needs BRICS countries to build capacity in invasion science. PLoS Biol 17(9): e3000404. https://doi. org/10.1371/journal.pbio.3000404
Мироновский А. Н., Дгебуадзе Ю.Ю., Мэндсайхан Б., Слынько Ю.В. Морфологическая дифференциация алтайского османа Oreoleuciscus humilis (Cyprinidae) в реке Туйн-Гол, Долины озер, Монголия // Вопросы ихтиологии. 2019. Том 59. №1.С. 105-109.
Дгебуадзе Ю.Ю., А. Н. Мироновский, Б. Мендсайхан, Ю.В. Слынько. Быстрая морфологическая диверсификация карповой рыбы Oreoleuciscus potanini (Cyprinidae) при образовании водохранилища на реке семиаридной зоны // Докл. Академии наук. Науки о жизни, 2020, том 490, с. 85–89.