1891
Гидробиологическая станция «Глубокое озеро» - старейшая в нашей стране и мире пресноводная биологическая станция была основана в 1891 г. по инициативе председателя Отдела ихтиологии Императорского Русского Общества акклиматизации животных и растений, профессора Московского университета Н.Ю. Зографа. Первым ее заведующим стал будущий академик С.А. Зернов.
1972
Группа экологии сообществ пресноводных животных (впоследствии Группа экологии пресноводных сообществ) под руководством д.б.н. Н.Н. Смирнова была создана в Институте эволюционной морфологии и экологии животных им. А.Н. Северцова АН СССР (с 1995 г. Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН – ИПЭЭ РАН) в 1972 г.
1999
Группа экологии инвазий и межпопуляционных взаимодействий под руководством Ю.Ю. Дгебуадзе была создана в ИПЭЭ РАН по инициативе академика Д.С. Павлова в 1999 г. Создание группы было обусловлено исключительной актуальностью проблемы биологических инвазий и необходимостью развития исследований по данной тематике в Отделении биологических наук РАН. Группа являлась первым и единственным (и остается в настоящее время в рамках лаборатории) структурным подразделением по инвазионной тематике в системе РАН.
2006
Лаборатория была образована в 2006 г. в результате объединения Группы экологии пресноводных сообществ, руководимую профессором Н.Н. Смирновым и Группы экологии инвазий и межпопуляционных взаимодействий (руководитель академик Ю.Ю. Дгебуадзе).
В дальнейшем научные сотрудники группы развивали исследования не только на биостанции, но и в других регионах России и мира и внесли существенный вклад в исследования систематики, фаунистики, морфологии и экологии гидробионтов.
