Основные задачи Лаборатории: разработка теории и практики гармонизации взаимоотношений человека и птиц на основе мониторинга, изучения поведения и экологии видов, в первую очередь – редких, колониальных и хозяйственно значимых.
В настоящее время в ЛЭУПП проводятся исследования по следующим направлениям:
- биологическое разнообразие птиц, мониторинг редких и хозяйственно важных видов;
- теоретическое и практическое изучение колониальности у птиц;
- эколого-орнитологический мониторинг;
- минимизация/предотвращение биоповреждающей деятельности птиц с помощью управления их поведением на хозяйственно важных объектах без причинения вреда птицам;
- охрана птиц и их местообитаний;
- акустическая коммуникация птиц;
- морфология перьев (птилология).
ЛЭУПП – единственная в России лаборатория, где проводятся идентификационные исследования по микроструктуре одиночных перьев и/или их фрагментов, в частности, в интересах авиационной орнитологии.
ЛЭУПП координирует деятельность ведомственных и академических учреждений в области прикладной орнитологии в рамках:
- Международного комитета по прикладной орнитологии,
- Европейского и Международного комитетов по опасности птиц для самолетов,
- Научного Совета РАН по биоповреждениям.