Лаборатория фауны, экологии паразитов и экспериментальной паразитологии была создана в 1973 г., её заведующим был член-корр. АН СССР М.Д. Сонин, затем – В.А. Ройтман и проф. С.А. Безр. В 2017 г. в состав лаборатории вошла Группа экспериментальной паразитологии, созданная на основе Лаборатории экспериментальной паразитологии ЦП ИПЭЭ РАН, существовавшей в этом качестве с 1994 г. Руководитель группы – д.б.н., академик НАН Армении С.О. Мовесеян.