1. Говорка Я., Митух Я., Маклакова Л.П., Пельгунов А.Н., Рыковский А.С., Семенова М.К., Сонин М.Д., Эрхардова-Котрла Б., Юрашек В. Гельминты диких копытных Восточной Европы. –М.: Наука. 1988. 208 с.
2. Пельгунов А.Н. Паразиты и паразитарные системы в радиационных биоценозах (зона аварии Чернобыльской АЭС). –М.: Наука. 2005 208 с.
3. Пельгунов А.Н., Рябов И.Н., Павлов Д.С., Родин В.М., Филиппова А.Ю. Способ обеззараживания продуктов животного происхождения в поле СВЧ.- Патент № 2238013 от 20.10.2004 г.
4. Sonin M.D., Pelgunov A.N., Larchenko T.T., Soshkin D.V. Changes in Parasitophauna of Murid Rodents in Zone of Radio Contamination.// Biological Diversity Dynamics in Areas Contaminated by Radionuclides Released during Chernobyl Accident. Proceedings of the MAB-CESN Inter meet M. December 1994. Radiation Biology and Ecology. Special Issue. 1994. P. 43-46.
5. Пельгунов А.Н. Радиоустойчивость организмов и роль геометрического фактора при внешнем облучении.// Ж. Экологические системы и приборы М. Научтехлитиздат. 2000. № 2. С. 18-21.
6. Пельгунов А.Н. Действие радиоактивного излучения на поле «ясной погоды» в зоне Чернобыля.// Ж. Экологические системы и приборы. М. Научтехлитиздат. 2000. № 6. С. 12-14.
7. Пельгунов А.Н. Некоторые аспекты экологии Плещеева озера («Золотое Кольцо»).// Ж. Экологические системы и приборы. М.: Научтехлитиздат. 2003 № 12. С. 21-23.
8. Пельгунов А.Н. Радиоустойчивость паразитов и митотическая активность на разных стадиях онтогенеза.// Успехи общей паразитологии (Труды ИНПА РАН Т. 44) 2004. М.: Наука. С. 239-245.
9. Пельгунов А.Н., Рябов И.Н., Филиппова А.Ю. Использование микроволновых печей в профилактике описторхоза.// Ж. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2005. № 3. С. 42-45.
10. Пельгунов А.Н. Проблемы описторхоза и дифиллоботриоза в нижнем течении Иртыша.// Российский паразитологический журнал. М. 2012 № 3. С 68-73.
11. Пельгунов А.Н., Маклакова Л.П. Паразитологические аспекты, связанные с акклиматизацией и интродукцией диких копытных// Российский паразитологический журнал. Москва. 2013 № 3. С. 67-75.
12. Pelgunov A.N., Damianova A.A., Lomakin V.V. Morphological Changes in Heligmosomum mixtum (Schulz, 1952) Eggs in 30-km Zone of Cernobyl Atomic Power Station, Ukraine.// Journal of Balkan Ecology V. 16, N 1, 2013 P. 73-77.
13. Пельгунов А.Н. Формирование цестодофауны двух видов куликов рода Calidris в местах гнездовий // Зоологический журнал. 2019. Т. 98. № 7. 725-731.