Заболевания гепатитом E являются причиной смерти более 40000 человек ежегодно. Резервуаром данного патогена могут быть как парнокопытные, так и крысы, что свидетельствует о зоонозном потенциале гепевирусов грызунов.
Для оценки этого потенциала, международным коллективом исследователей, включающим заведующего лабораторией микроэволюции млекопитающих ИПЭЭ РАН д.б.н. Л.А. Лавренченко, проведено масштабное исследование мелких млекопитающих (2565 экземпляров 108 видов грызунов и землероек) Африки, Азии и Латинской Америки. Описаны 24 новых полных генома, все они обладали типичной для гепевирусов организацией с тремя частично пересекающимися открытыми рамками считывания (ORF1, ORF2 и ORF3), а также с характерными функциональными доменами и мотивами. Два тарбаганчика (Pygeretmus pumilio) из семейства тушканчиковых (Dipodidae) были коинфицированы двумя различными глубоко дивергировавшими гепевирусами, различия между которыми по аминокислотным последовательностям составляли более 20%. Гепевирусы грызунов оказались гораздо более разнообразными, чем гепевирусы летучих мышей и птиц, которые формируют монофилетические клады. Гепевирусы грызунов группируются в девять клад, занимающих базальные позиции по отношению к человеческому (HEV, клады 1-5) и крысиному (RHEV, клады a-d) вирусам гепатита E.
Методами парсимониального анализа и ко-филогенетического соответствия показано, что именно грызуны были основным источником “перехода” гепевирусов между различными отрядами млекопитающих. “
«Реконструкция предкового состояния, проведенная методами байесовского анализа, показала недавнее прямое происхождение человеческого вируса гепатита E от гепевирусов парнокопытных (свиней и верблюдовых) и более древнее – от гепевирусов грызунов», - рассказал д.б.н. Л.А. Лавренченко.
Авторами исследования показана перспективность использования некоторых видов грызунов в качестве новых моделей для исследований патогенеза вируса гепатита E и разработки его доклинической терапии и обоснована необходимость геномного эпиднадзора за гепевирусами, связанными с грызунами.
Работа опубликована в журнале: Jo W.K., Cassiano M.H.A., de Oliveira-Filho E.F., Brünink S., Yansanjav A., Yihune M., Koshkina A.I., Lukashev A.N., Lavrenchenko L.A., Lebedev V.S., Olayemi A., Bangura U., Salas-Rojas M., Aguilar-Setién Á., Fichet-Calvet E., Drexler J.F., 2024. Ancient evolutionary origins of hepatitis E virus in rodents. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 121(51): e2413665121.