На протяжении многих лет ИПЭЭ РАН успешно сотрудничает с Кроноцким государственным биосферным заповедником, внесенным в список природных объектов ЮНЕСКО. Результатом сотрудничества стали многочисленные публикации в российских и зарубежных изданиях, подготавливаемые к защите диссертационные работы. В ходе совместных работ между сотрудниками института и заповедника сложись хорошие деловые и теплые дружеские отношения. В 2022 году коллективами обеих организаций была запланирована крупная экспедиция по изучению Кроноцкого озера - уникального водоема, колыбели самого богатого по числу форм на планете симпатрического комплекса лососевых рыб.
ИПЭЭ РАН с большим сожалением сообщает, что запланированные в настоящем году работы, по-видимому, не состоятся, поскольку с 19 июля 2022 года заповедник вынуждено приостанавливает научно-исследовательскую деятельность на своей территории. Решение заповедника связано с заключением под стражу по приговору городского суда Петропавловска-Камчатского ключевых сотрудников организации, обвиненных в хищении выделенных из госбюджета средств. Согласно мнению коллектива заповедника и материалам, представленным на сайте заповедника http://kronokiochistka.wildnet.ru/, во время процессуальных действий были допущены многочисленные нарушения и не учтены фактические материалы и свидетельства очевидцев, доказывающие невиновность осужденных сотрудников. В знак протеста директор заповедника и ряд других его сотрудников написали заявления об увольнении по собственному желанию, что привело к приостановке всех научных и экскурсионных работ на территории заповедника.
Сотрудники ИПЭЭ РАН крайне заинтересованы в возобновлении работ на территории заповедника и, соответственно, в восстановлении нормального режима его работы, искренне надеются на скорейшее и объективное рассмотрение дела в апелляционном суде.