Перейти к основному содержанию

КАБИНЕТ БИОИНФОРМАТИКИ И МОДЕЛИРОВАНИЕ БИОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ

 

Логотип кабинетаЗаведующий кабинетом  — д.б.н., гл.н.с. Петросян Варос Гарегинович

Тел. Раб. 8(495)952-72-83   Факс- (495) 954-55-34

 

Миссия кабинета - информационное и программное обеспечение исследований биологических систем на основе методов и средств биоинформатики и моделирования. Разработка компьютерных программ для поддержки собственных научных исследований и исследований, проводимых другими дружественными подразделениями ИПЭЭ РАН. Сотрудники кабинета также проводят научные исследования по независимым тематикам.

О Кабинете

Петросян Варос Гарегинович - основатель и многолетний заведующий кабинетом “Биоинформатики и моделирования биологических процессов”. Кабинет организован в 2001 г.

Ученая степень - доктор биологических наук, кандидат технических наук.

Образование – в 1981 г. закончил Московский физико-технический институт (МФТИ), с 1984 г. – кандидат технических наук (защита диссертации на совете при МФТИ), с 2004 – доктор биологических наук  (защита диссертации д.б.н. на совете при МГУ им. М.В. Ломоносова).

 

 

Научные награды, общества

Лауреат международной премии им. Г. Форда (1998 г.) - за разработку интегрированной информационной системы - “Integration of ground truth and spaceborne sensor data with a GIS for coastal zone management of the Turkish Mideterranean coasts”;

Удостоен главной премии по биологии МАИК “Наука/Интерпериодика” за цикл работ, опубликованных в журнале “Генетика” в 2001-2003 гг.;

Заместитель главного редактора "Российского журнала биологических инвазий";

Член международного комитета по созданию информационной системы и базы данных по чужеродным видам северо-европейских и балтийских стран (NOBANIS, North European and Baltic Network on Invasive Alien Species, http://www.nobanis.org). В состав комитета входят представители из 26 стран Евросоюза;

Член российского национального комитета РАН по сбору и оценке численных данных в области науки и техники (КОДАТА);

Член комиссии РАН по сохранению биологического разнообразия, зам. председателя секции информатизация исследований в области биоразнообразия.

Член ученого совета ИПЭЭ РАН,

Член Совета при ИПЭЭ РАН по защите докторских и кандидатских диссертаций.

Член оргкомитета IV международного симпозиума «Чужеродные Виды в Голарктике» (БОРОК – 4), 22 – 28 сентября 2013 г. п. Борок, Ярославская область, Россия.

Член оргкомитета V международного симпозиума «Чужеродные Виды в Голарктике» (БОРОК – 5), 25 – 30 сентября 2017 г. п. Углич, Ярославская область, Россия.

Член оргкомитета "Публикация данных в Глобальной Информационной Системе по Биоразнообразию - GBIF", ИПЭЭ РАН,  GBIF-Дания,  октябрь 16, 2015;

Соорганизатор с российской стороны международной рабочей группы по экологии митотического драйва, Швейцария, г. Цюрих, Университет Цюриха, 21-27 июня 2015 г.

Аккредитован и включен в Федеральный реестр экспертов научно-технической сферы Минобрнауки России (Регистрационный номер № 06 – 01537, от 25 июня 2015 г.);

Включен в список экспертов Российской академии наук (РАН), выдан сертификат эксперта РАН, Идентификационный номер эксперта 2016-01-5643-6268, Распоряжение Президиума РАН от 27.07.2016 № 10108-509;

Член международной экспертной группы, организованной по инициативе GBIF (Global biodiversity Information Facility) (http://www.gbif.org/newsroom/news/invasive-alien-species-task-group-launched, 6 июня 2016 г., Дания) с целью оценки пригодности данных и улучшения функциональных возможностей GBIF для сбора и хранения информации по чужеродным и инвазионным видам на глобальном, континентальном, региональном и национальном уровнях.

 

Международные визиты и сотрудничество:

        США -Fish and Wildlife Service, USA (1991-1992; a два месяца  каждый год)

        США - University of Alaska Fairbanks, Juneau, Alaska, USA  (1993-1994; два месяца каждый год)

        США - USGS , Anchorage, Alaska, USA 1997 – три месяца)

      Турция- Istanbul, Technical University, Turkey (1997, 2 месяца)

        Италия- Italian National Academe of Science, Rome (2002, 1 месяц );

        Дания - Copenhagen, Denmark, NOBANIS meeting (2006, 2 месяца  );

        Италия - Siena, Italy Zoological congress (2007, 2 две недели );

        Франция - Paris, France International symposium (2008, две недели );

        Дания  - Copenhagen, Denmark, GBIF meeting (2009, две недели );

Польша -7th International Moose Symposium, Mammal Research Institute of the Polish Academy of Sciences (2012- две недели)

Хорватия - 6th International Beaver Symposium. Faculty of forestry, University of Zagreb, Croatia (2012- две недели);

Республика Армения - II Международная научная конференция Биологическое разнообразие и проблемы охраны фауны КавказаЕреван, Республика Армения, 23 - 26 сентября 2014 г;

Республика Беларусь -  Международная Научно-Практическая Конференция "Современные технологии в деятельности ООПТ" (ГИС-Нарочь_2014), Минск-Нарочь, 12–16 мая 2014 г.

Швейцария – WorkShop “Ecology of meiotic drive”(21- 27 июня, 2015г.);

Кипр - 9th Symposium on the Lacertids of the Mediterranean Basin & 1st Symposium on Mediterranean Lizards (Limassol, Cyprus), 20-23 June, 2016;

Люксембург – NEOBIOTA 2016. Biological Invasions: Interactions with Environmental Change 9th International Conference on Biological Invasions Vianden, Luxembourg.14-18 September 2016;

Германия – WorkShop “Strategic approaches and interventions for improving data fitness for use for A&IS”. GBIF Task Group on Data Fitness for use in Research on Invasive Alien Species, German Centre for Integrative Biodiversity Research, Leipzig, Germany, 9-11 July 2016

Австралия – WorkShop “Top priorities and key recommendations for improving the data fitness for use for alien and invasive species”. GBIF Task Group on Data Fitness for use in Research on Invasive Alien Species, School of Biological Sciences at the Monash University, Clayton, Melbourne, Australia, 8-14 October 2016;

Польша – WorkShop, University of Biatystok and Polish National Academy of Science "Mechanisms affecting the transfer of matter and energy from phytoplankton to zooplankton in freshwater ecosystems", 10 June -25 June, 2017.

 

Руководство (участие) в Российских и международных программах (грантах)

1.Гранты РФФИ  в период - 1996 -2009 гг.:

96-04-49409-а, 98-04-48799-а, 01-04-48388-а, 01-04-49850-а, 01-04-96006-р2001центр, 02-04-48516-а, 02-04-49946-а, 02-04-63143-к, 03-04-96314-р2003центр_а, 04-04-49436-а, 06-04-96302-р_центр_а, № 09-04-91331-ННИО_а;

Грант Службы рыбы и дичи, США (Программа V «Охрана природы и организации заповедников» в рамках Российско-Американского соглашения об охране окружающей среды и природных ресурсов). -№ 98210-5-G249 Создание WEB-ориентированной информационно-поисковой системы по фауне и флоре заповедников России”, 2006-2007гг;

Грант РФФИ 08-04-00668-а по теме “Молекулярная природа аллельного полиморфизма микросателлитных локусов у партеногенетических ящериц рода Darevskia”; Сроки выполнения 2008-2010, Исполнитель

Проекты и гранты за последние 5 лет:

1. Грант РФФИ № 11-04-00754-а по теме “Геномный полиморфизм и генетическое разнообразие партеновидов рода Darevskia”; Сроки выполнения 20011-2013 гг., Исполнитель;

2. Грант РФФИ № 12-04-90859-мол_рф_нр по теме “Изучение влияния речного бобра (Castor fiber L.) на экосистемы особо охраняемых природных территорий РФ с использованием информационных технологий”. Сроки выполнения 2012 г.; Руководитель;

3. Грант РФФИ №  15-04-06423. “Экологические последствия восстановления численности речного бобра (Castor fiber L.) в субоптимальных и пессимальных местообитаниях экосистем малых рек на примере особо охраняемых природных территорий Европейской части России”, сроки выполнения 2015-2017; Руководитель;

4. Грант РФФИ № Офи_м  15-29-02528 “Инвентаризация коллекции паразитических червей Гельминтологического музея ИПЭЭ РАН и создание WEB–ориентированной информационно-поисковой системы в целях интеграции междисциплинарных исследований по систематике, морфологии, зоогеографии и эволюции этих организмов.”, 2015-2017; Исполнитель;

5. Грант РФФИ Офи_м 15-29-02550  “Исследование инвазий чужеродных видов организмов, представляющих наибольшую опасность для экосистем Европейской части России: пути распространения, векторы, биологические особенности и методы контроля”, 2015-2017; Исполнитель;

6. Программа фундаментальных исследований Отделения биологических наук РАН - «Биологические ресурсы России: оценка состояния и фундаментальные основы мониторинга», тема-“Создание комплекса имитационных моделей для оценки динамических трендов ресурсных популяций парнокопытных на основе многолетних данных наземного мониторинга и космических измерений”; Cроки выполнения 2009-2011 гг; Руководитель;

7. Программы фундаментальных исследований Президиума РАН «Биологическое разнообразие», тема – “Информационное обеспечение инвентаризации фауны позвоночных животных России (включая особо-охраняемые природные территории)”- Сроки выполнения 2009-2011 гг.; Руководитель;

8. Федеральная целевая Программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы, Шифр «2012-1.1-12-000-1001-064», Соглашение от 20 июля 2012 г. № 8051, «Разработка технологий оценки рисков и экологических способов контроля инвазий чужеродных видов организмов на территорию Европейской части России», Сроки выполнения 2012-2013; Ответственный исполнитель;

9. Федеральная целевая Программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы, Шифр «2010-1.1-234-069-065», Государственный контракт от 28 июня 2010 г. № 02.740.11.0867, «Создание базы данных по биологическим инвазиям чужеродных видов и другим формам антропогенного воздействия на экосистемы Волжско-каспийского бассейна; разработка научных основ предупреждения и экологических способов контроля таких воздействий», Сроки выполнения 2010-2012; Ответственный исполнитель;

10. Федеральная целевая Программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы, Шифр «2010-1.1-220-142-050», Государственный контракт от 20 сентября 2010 г. № 14.740.11.0410, «Комплексный мониторинг параметров океана и атмосферы для оценки динамики таяния арктических льдов и влияния изменений климата на арктические экосистемы», Сроки выполнения 2010-2012, Ответственный исполнитель;

11. Программа Призидума РАН. «Живая Природа: Современное состояние и проблемы развития», “Разработка и усовершенствование комплекса WEB-ориентированных информационно – аналитических систем инвентаризации фауны позвоночных животных России и флоры природных государственных заповедников (ООПТ) с использованием современных технологий Google Maps API”; Сроки выполнения 2012-2014; Руководитель;

12. Программа фундаментальных исследований. Отделения биологических наук. «Биологические Ресурсы России: Динамика в условиях глобальных климатических и антропогенных воздействий», «Математические модели и базы данных для управления популяциями важнейших ресурсных видов парнокопытных России и разработка практических рекомендаций по нормированию использования ресурсов охотничьих животных», сроки выполнения 2012-2014; Руководитель;

13. Биологическая инвазия чужеродных видов организмов в наземные и водные экосистемы в условиях глобальных климатических и антропогенных воздействий, грант Российского научного фонда, сроки выполнения 2016-2018, руководитель;

14. Грант РФФИ  № 17-04-00396 Происхождение и формирование клонального разнообразия у однополых (партеногенетических) видов ящериц рода Darevskia, 2017-2019 г., исполнитель

 

Экспертная деятельность

Рецензирование с 2012 по 2017 гг более 40 статей, изданных в отечественных и международных журналах – Российский журнал биологических инвазий, Доклады РАН, Известия РАН серия биологическая, Генетика, Успехи современной биологии, Ecology and Evolution, Arctic research, Springer Plus, PLoS ONE, Biological Invasion, Gen Genet, Journal of Heredity и др.

Экспертиза заявок и отчетных материалов - 32 в 2007 г.,  20 в 2008 г.,  12 в 2009 г., 6 в 2010 г., 29 в 2011 г., 24 в 2012 г., 8 в 2013г; проводимых в рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»», организатор конкурса Министерство образования и науки РФ (тематики экспертизы– биоинформатика, информационные системы, базы данных, математическое моделирование, биологическая инвазия);

Экспертиза заявок  и отчетных материалов - 14 в 2014 г., 14 в 2015 г., 17 в 2016 г., 8 в 2017 г., проводимых по Фонду информационного обеспечения науки (ФИОН) в рамках мероприятий Программы "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы" (тематики экспертизы - биоинформатика, информационные системы, базы данных, математическое моделирование, биологическая инвазия).

Экспертиза 3 проектов 2008-2010 гг. в рамках “Международных Программах РФФИ с фондами других стран в области биоинформатики и применения информационной технологии в биологии и экологии;

Экспертиза “Проекта нормативов допустимого остаточного содержания нефти (ДОСН) в донных отложениях водных объектов автономного округа для оценки качества проведения восстановительных работ (по очистке дна)”, представленного в рамках выполнения работ по Государственным контрактам № 187 и 188 (от 28 ноября 2011 г.) целевой программы ХМАО-Югры «Обеспечение экологической безопасности ХМАО-Югры в 2011-2113 г»;

Экспертиза 3 заявок Российского научного фонда в 2015 г. (тематики - динамика популяций и сообществ гидробионтов, система комплексного мониторинга почв, популяций сельскохозяйственных животных и растений, полногеномный анализ ассоциаций по локусам количественных признаков);

Экспертиза 3 заявок Российского научного фонда в 2016 г. (тематикатрансформации биоценозов при инвазии/интродукции чужеродных видов; эволюция взаимных адаптаций в системе при вселении чужеродных видов, мониторинг влияния климатических изменений на уязвимые экосистемы);

Экспертиза 7 заявок Российского научного фонда в 2017 г. (тематика – инновационные принципы и методы информационно-измерительных систем; анализ методик статистической обработки прямых и дистанционных данных в земледелии, оценки эффективности применения беспилотного автономного комплекса в экологии, обезвреживание и утилизация загрязнителей оз. Байкал и его водосборного бассейна, климатогенная динамика древесной растительности и ее влияние на изменение запасов углерода на локальном и региональном уровнях, мониторинг расширения ареалов южных видов членистоногих; моделирование сценариев инвазии моллюсков в Западной Сибири);

Экспертиза 4 научных результатов в 2017г, полученных за счет средств федерального бюджета и проводимых в рамках экспертной системы РАН (тематика - математическое моделирование и прогнозирование состояний и процессов комплексной безопасности городской среды; биотические компоненты экосистем, их свойства, ресурсный потенциал и динамика в условиях трансформации природной среды).

Основные направления исследований - информационное и программное обеспечение исследований биологических систем, включающие

  1. Изучение механизмов молекулярной эволюции геномов рептилий рода Darevskia, приведших к возникновению партеногенеза у этих животных;

2.       Развитие информационных технологий (создание экспертно –аналитических и справочных информационных систем, растрово-векторных баз данных, разработка специальных программ для оценки генетической структуры популяции и филогенетических связей таксонов видового и надвидового уровней) на основе результатов исследований живой природы;

3.       Создание специальных моделей, методов, алгоритмов и программ для пространственно - временного анализа динамики популяций в условиях изменяющегося климата и антропогенных воздействий;

4.       Изучение теоретических вопросов биологических инвазий - инвазионные коридоры, векторы инвазий, адаптации видов–вселенцев, оценка риска инвазий, генетические, биологические, биогеографические и эволюционные аспекты влияния чужеродных видов на биологическое разнообразие биосистем различных уровней организации.

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

1. Изучение механизмов молекулярной эволюции геномов рептилий рода Darevskia, приведших к возникновению партеногенеза у этих животных;

1.1.Установлено клональное разнообразие и формирование клонов партеногенетического вида Darevskia dahli (111 особей самок  D. dahli из 5  популяций; 72 особей  - первый основной клон; 21 особей – 2 промежуточный клон; остальные особи представляют 9 редких клонов, которые представлены  несколькими особями). На рисунке показана филогенетическая сеть, построенная при помощи моделирования мутаций, на основе принципа минимальной эволюции, характерного для использованных маркерных локусов. Данная схема демонстрирует три независимых линии наследования, вероятно, возникших в результате трех независимых актов гибридизации при образовании партеногенетического вида D. dahli (Clonal Diversity and Clone Formation in the Parthenogenetic Caucasian Rock Lizard Darevskia dahli, PlosONE, 2014, p. 1-9)

 

 

 

 

 

1 2

 


Рис. 1.1. Из статьи - Clonal Diversity and Clone Formation in the Parthenogenetic Caucasian Rock Lizard Darevskia dahli, PlosONE, 2014, p. 1-9

 

 

1.2. Проведен анализ генетических параметров популяций ящериц комплекса Darevskia raddei (D. raddei nairensis и D. raddei raddei) и популяций D. valentini на основе анализа изменчивости 50 аллельных вариантов трех микросателлит содержащих локусов ядерных геномов у 83 особей. На рисунке показано  филогенетическое дерево популяций D. r. raddei, D. r. nairensis и D. valentini, построенное на основании расстояний Fst алгоритмом кластеризации по методу “ближайшего соседа” с бутстреп поддержкой в 1000 итераций. Данный рисунок (2) демонстрирует, что популяции D. r. nairensis значимо отличаются от популяций D. r. raddei. Это свидетельствует о глубокой дивергенции популяций D. Raddei raddei и D. raddei nairensis комплекса D. raddei и ставит вопрос о возможности отнесения их к разным видам (Омельченко, и др. 2016, Генетика)

3

Рис. 1.2. Из статьи -  Омельченко А.В., Гирнык А.Е., Осипов Ф.А., Вергун А.А., Петросян В.Г., Даниелян Ф.Д., Аракелян М.С., Рысков А.П. Генетическая дифференциация природных популяций ящериц комплекса Darevskia raddei по данным микросателлитного маркирования геномов  

 

1.3. Проведен анализ аллельного полиморфизма трёх микросателлитсодержащих локусов (Du215, Du281, Du323) в популяциях D. rostombekowi (42 особи, из 4 популяций Армении) с помощью монолокусной ПЦР (с последующим клонированием и секвенированием продуктов амплификации). Было выявлено 11 аллельных вариантов трех локусов, которые отличаются по структуре микросателлитов и по однонуклеотидным вариациям – SNVs (single nucleotide variations), расположенным на фиксированных расстояниях от микросателлитного кластера и образующих различные сочетания – гаплотипы, характерные для определенных аллелей. Для установления, какие из этих аллелей имеют отцовское, а какие − материнское происхождение, был проведен ПЦР-анализ гомеологичных локусов у родительских видов (65 особей из 13 популяций D. raddei и 27 особей из 2 популяций D. portschinskii). Полученные ПЦР-продукты были клонированы и секвенированы. Показано, что аллели двуполых видов весьма разнообразны по структуре микросателлитов и также, в случае локусов Du281 и Du323, содержат однонуклеотидные вариации вне микросателлитов. По сочетанию этих вариаций и специфической структуре микросателлита было определено, от какого родительского вида унаследован тот или иной аллель каждого локуса у партеновида. По сочетанию аллелей каждого локуса были установлены генотипы для всех 42 особей D. rostombekowi. Особи с идентичными генотипами представляли отдельные клональные линии. Всего было детектировано 5 генотипов (представлены на рисунке ниже), которые различались по частоте встречаемости и географическому распространению. Наиболее распространенным оказался генотип 1, встречающийся у 24 особей (57,1%) из трех популяций. Генотипы 2 (8 особей – 19%) и 3 (8 особей – 19%) представлены в двух и одной популяциях соответственно. Редкие генотипы 4 и 5 представлены у одной особи для каждого (по 2,38%). Генотипическое разнообразие в четырех популяциях варьирует от 0% до 75% (в среднем 11,9%). Таким образом, полученные данные свидетельствуют о мультиклональности партеногенетического вида D. rostombekowi, в отличие от ранее предложенной моноклональности, основанной на аллозимном анализе. Комбинации определенных родительских однонуклеотидных замен, наследуемые партеновидом, формируют генотип-специфические маркеры, которые идентифицировали единичный акт межвидовой гибридизации, приведший к формированию одного основного (самого распространенного) клона. Другие клоны, различающиеся только по структуре микросателлита, возникали в результате мутаций в микросателлитном кластере основного клона. Таким образом, разработанный нами подход генотипирования может найти универсальное приложение для оценки клонального разнообразия и определения его происхождения у любых видов животных гибридного происхождения. (Ryskov A.P., Osipov F.A., Omelchenko A.V., Semyenova S.K., Girnyk A.E., Korchagin V.I., Vergun A.A., Murphy R.W. (2017) The origin of multiple clones in the parthenogenetic lizard species Darevskia rostombekowi // PLoS ONE 12(9): e0185161. https: //doi.org/10.1371/journal.pone.0185161).

 

4

Рис. 1.3. Из статьи - Ryskov A.P., Osipov F.A., Omelchenko A.V., Semyenova S.K., Girnyk A.E., Korchagin V.I., Vergun A.A., Murphy R.W. (2017) The origin of multiple clones in the parthenogenetic lizard species Darevskia rostombekowi // PLoS ONE 12(9): e0185161

 

2.Развитие информационных технологий на основе результатов исследований живой природы

2.1. Павлов Д.С., Петросян В.Г., Дгебуадзе Ю.Ю., Рожнов В.В., Решетников Ю.С., Павлинов И.Я., Корнеева Т.М., Бессонов С.А., Хляп Л.А., Варшавский А.А., Дорофеева Е.А., Сиделева В.Г., Попова О.А., Бобров В.В., Омельченко А.В., Назаренко Е.А. Web-ориентированная информационная система и интегрированная база данных по разнообразию позвоночных животных России.

База данных позвоночных животных России включает виды и подвиды 1430 пресноводных и морских рыб, 29 - земноводных, 84 – пресмыкающихся, 739 - птиц и 310 – млекопитающих. Информационная система позвоночных животных содержат все известные на сегодня виды, валидность которых не была пересмотрена в соответствующих систематических ревизиях. Для описания каждого вида принята общая концептуальная модель представления данных. БД предназначена для экологов, зоологов, ихтиологов, ботаников, географов. БД функционирует на основе мультифреймовой технологии в трех различных режимах: обзора, запроса и поиска. Режим обзора предназначен для навигации по иерархическому дереву при выборе вида из базы данных. Режим запроса и поиска обеспечивает функциональную мобильность для полнотекстового контекстного поиска в интегрированной базе данных.

 

5

Рис. 2.1. Свидетельство о регистрации базы данных

 

2.2. Павлов Д.С., Петросян В.Г., Дгебуадзе Ю.Ю., Рожнов В.В., Бессонов С.А., Решетников Ю.С., Корнеева Т.М., Нухимовская Ю.Д., Дергунова Н.Н., Омельченко А.В. Web-ориентированная информационно-поисковая система по фауне и флоре особо охраняемых природных территорий (заповедников) России.

Информационно-поисковая система включает интегрированную базу данных организмов, охраняемых в настоящее время на заповедных территориях России. Русско-английская версия системы реализована на примере рыбообразных и рыб (321 вида), земноводных (26) и пресмыкающихся (56), птиц (696), млекопитающих (254), антоцеротовых и печеночников (328), мхов (883), лишайников (2015) и сосудистых растений (7920 видов).  БД предназначена для экологов, зоологов, ихтиологов, ботаников, географов. Информационная система, включающая интегрированную базу данных, которая функционирует на основе мультифреймовой технологии в трех различных режимах: обзора, запроса и поиска. Режим обзора предназначен для навигации по иерархическому дереву при выборе вида из базы данных. Режим запроса и поиска обеспечивает функциональную мобильность для полнотекстового контекстного поиска в интегрированной базе данных.

6

Рис. 2.2. Свидетельство о регистрации базы данных

 

 

2.3. Павлов Д.С., Петросян В.Г., Дгебуадзе Ю.Ю., Бессонов С.А., Омельченко А.В., Дергунова Н.Н. Генетические и биологические (зоологические и ботанические) коллекции Российской Федерации: База данных с WEB-ориентированным доступом

Созданная единая база данных генетических и биологических коллекций микроорганизмов, клеточных культур, гербариев, ботанических садов и живых организмов в заповедниках России предназначена для выполнения ключевых функций по проблеме инвентаризации и документирования генетических ресурсов в Российской Федерации. БД предназначена для генетиков, экологов, зоологов, ихтиологов, ботаников и географов, и является информационной основой для создания новых лекарственных препаратов, биотехнологий и прочих товаров и услуг.

 

7

Рис. 2.3. Свидетельство о регистрации базы данных

 

 

2.4. Петросян В.Г., Рожнов В.В., Хляп Л.А., Бессонов С.А., Омельченко А.В., Варшавский А.А. Региональные фауны млекопитающих России: База данных с WEB-ориентированным доступом

БД “Региональные фауны млекопитающих России” c WEB-ориентированным интерфейсом предназначена как для специалистов биологов, так и для широкого круга пользователей. Ее можно использовать с целью унификации сбора, обработки и обмена зоологической информацией, для оценки таксономического разнообразия, а также мониторинга с целью оценки изменений параметров разнообразия, как на региональном, так и на федеральном уровнях. Она пригодна для использования в справочных и ознакомительных целях для пользователей любого уровня квалификации.

8

Рис. 2.4. Свидетельство о регистрации базы данных

 

 

2.5. Рожнов В.В., Букварева Е.Н., Петросян В.Г., Бессонов С.А. WEB-ориентированная информационно-поисковая система-"Красная Книга Российской Федерации"

Общедоступная информационная система и интегрированная база данных по редким и исчезающим видам Российской Федерации. Информационная система состоит из двух частей – "Красная книга Российской Федерации (животные)" – 434 вида и "Красная книга РСФСР (растения)" – 533 вида.

9

Рис. 2.5. Свидетельство о регистрации базы данных

 

2.6. Петросян В.Г., Зиновьева С.В., Филимонова Л.В., Ломакин В.В., Удалова Ж.В. Хасанова О.С. Буторина Н.Н. Геннадиева Т.М. База данных Гельминтологического музея Российской академии наук в среде локальной информационно - поисковой системы Helminthsys

Разработанная база данных (БД) Гельминтологического музея РАН в среде  локальной  информационно-поисковой системы Helminth_Sys (ИПС) предназначена для создания единого методологического подхода, систематизации коллекций гельминтов, накопленных в музее более чем за 60 лет. ИПС способствует быстрой инвентаризации и систематизации всех коллекций, облегчает поиск сведений о всех таксонах, на основе единой концептуальной модели представления данных как типового и идентифицированного материала, так и неопределенных фондов. Основой для разработки локальной версии БД был избран формат Microsoft Access. Разработаны табличная и экранная формы ввода данных, позволяющие провести инвентаризацию каждого вида паразитических червей по следующим показателям: место в музее (номера препаратов или пробирок); адрес коллекции (типовая – объединяющая типовые экземпляры; общая – включающая формы, идентифицированные до вида; или массовая – объединяющая формы, идентифицированные до рода или надродового уровня); автор первоописания и год публикации; систематическое положение; характеристика типового материала или возрастно-полового и численного состава особей; место и время сбора; хозяин паразита; место локализации; авторы определения, коллекционирования и препарирования; сведения из полевого и музейного журналов, библиография. Всего 27 показателей, определяющих полную этикетку вида.

10

Рис. 2.6. Свидетельство о регистрации базы данных

 

2.7. Петросян В.Г., Зиновьева С. В., Филимонова Л.В., Ломакин В.В., Удалова Ж. В., Хасанова О.С., Буторина Н. Н., Геннадыева Т. М., Омельченко А.В., Бессонов С.А. Анализ фонда гельминтологических коллекций – Helminthsys.

Разработанное программное обеспечение Helminthsys предназначено для накопления, анализа и представления фонда гельминтологических коллекций музея РАН. Область применения: Биологические, сельскохозяйственные и медицинские науки Функциональные возможности программы: - ввод и редактирование, - организация регулярных и свободных запросов, - генерация отчетов, которые выполняются с помощью главного меню системы, включающего следующие разделы:  Файл, Правка, Запись, Вид, Формат, Сервис, Окно, Справка.

11

Рис. 2.7. Свидетельство о регистрации программы для ПЭВМ

 

2.8. Петросян В.Г. Интегрированная система управления базами данных и статистического анализ биологических данных - Biosystem office.

Biosystem office является компактной, мощной, высокопроизводительной, надежной и интегрированной системой управления базами данных и статистического анализа данных. Основные объекты системы сохраняются в одном единственном файле с расширением bdb. Система включает набор программных модулей для создания, модификации и сохранения основных объектов базы данных: таблиц, многотабличных форм, запросов, диаграмм и отчетов. Также, система включает методы описательной статистики; выявления выбросов; проверки статистических гипотез; множественного сравнения выборок и анализа долей, пропорций и сопряженных таблиц, дисперсионного и регрессионного анализов, а также методы многомерного анализа - кластерный анализ, главных компонент, дискриминантного анализа и  вероятностных нейронных сетей и сети Кохонена.

12

Рис. 2.8. Свидетельство о регистрации программы для ПЭВМ

 

3. Создание специальных моделей, методов, алгоритмов и программ для пространственно - временного анализа динамики популяций в условиях изменяющегося климата и антропогенных воздействий.

3.1. Проведен количественный анализ динамики численности важнейших ресурсных видов парнокопытных, характера их пространственного распределения и современной плотности животных для лесорастительных зон (хвойно-широколиственных лесов, таежной, лесостепной, степной зон, притундровых лесов и редкостойной тайги) России. На основе использования классических моделей популяционной динамики и анализа временных рядов показано, что для косули и кабана наблюдаются положительные тенденции увеличения численности за последние годы, а для лося отсутствуют положительные тенденции как на федеральном, так и на региональном уровнях. Представлены модели декомпозиции трендов, периодических и случайных составляющих динамики численности охотничье-промысловых видов. Приведены модельные оценки репродуктивного потенциала, годового воспроизводства и максимально возможной численности популяций изучаемых видов в рамках модифицированных дискретных моделей Мальтуса, Бивертона-Холта и Риккера (Петросян и др. 2012).

3.2.Разработана параметрическая дискретная модель (по времени) для анализа динамики численности бобров от вселения (1948 г.) до наших дней (2011 г.) в бассейне р. Таденки. Показано, что динамика численности популяции характеризуется стремлением к стационарному состоянию при наличии квазипериодической составляющей с периодами от 14 до 26 лет. Модельные оценки динамики показали, что периодическая составляющая имеет пилообразную форму, причем на каждом периоде в течение 6 лет численность бобров возрастает от минимального до максимального значения, а на остальной части периода уменьшается от максимального до минимального значения. Амплитуда колебаний квазипериодической составляющей составляет порядка 6 бобров и имеет слабую тенденцию к увеличению. Предполагается, что дальнейшее развитие бобровой популяции преимущественно будет зависеть от многих случайных событий, способствующих изменению таких регулирующих численность бобров факторов, как геоморфологические особенности местности, скорость восстановления кормов в заброшенных местообитаниях, масштабы и скорости развития бобровых поселений. Анализ устойчивости стационарного решения и оценка адекватности предложенной модели позволяют утверждать, что предлагаемая дискретная модель может быть использована для описания локальных популяций бобров других территорий с целью количественной оценки динамики их численности в зависимости от наличия доступных кормовых ресурсов(Petrosyan et al., 2013)

3.3. Издана коллективная монография, посвященной средообразующей деятельности бобра как ключевого вида малой реки на примере реки Таденки (Приокско-Террасный заповедник -ПТЗ). В этой монографии дано изучение динамики численности и распределения бобров в водоёмах заповедника с первых дней реинтродукции до настоящего времени (60 лет). Кроме этого охарактеризованы различные аспекты влияния бобров на водные и околоводные экосистемы малой реки Таденки, даны количественные и качественные характеристики влияния деятельности бобра на зоопланктон, макрозообентос, размножение амфибий, динамику черноольшаника и высшую водную растительность. Особое внимание уделено математическим моделям, предназначенным для выявления основных тенденций изменения численности и построения прогноза популяционной динамики с учетом особенностей экологии вида. Впервые проведен анализ потенциальных возможностей космических снимков среднего (Landsat 7) и сверхвысокого (IKONOS, GeoEye-1) разрешения для картирования объектов жизнедеятельности бобров на территории ПТЗ. Первичные данные были получены в ходе маршрутных обследований долин водотоков ПТЗ со спутниковым навигатором (GPS) в 2009–2012 гг. Были зафиксированы основные элементы бобрового ландшафта, при этом точечные объекты фиксировались одной точкой, линейные (плотины, бобровые пятна) – несколькими точками, площадные (бобровые пруды и луга) – картировались по периметру. Для комплексной обработки наземных и космических снимков нами была создана интегрированная база векторно-растровых данных в среде ГИС ArcGIS 9.3. Растровая часть базы данных включает космические снимки спутников серии IKONOS, Landsat 7 и GeoEye-1 за 2008, 2009 и 2010 гг. соответственно для территории ПТЗ и его охранной зоны (Речной бобр как ключевой… 2012)

3.4. Издана коллективная монография, в которой обобщены результаты оригинальных исследований авторов монографии и литературные данные по систематике, распространению, морфологии, экологии и роли ерша в разных пресноводных экосистемах. Ёрш имеет широкое распространение от Франции на западе до Колымы на востоке, в 1980-е годы началось его расселение в новые места - Италия, Франция, Ирландия; недавно попал в Северную Америку. Населяет реки, озера и осолоненные морские участки около дельты рек, отмечен от прибрежья до глубин 50-80 м, в реках избегает участков с быстрым течением. Ёрш имеет широкий спектр питания и может выступать как бентофаг, планктофаг и даже как хищник, поедая икру и молодь рыб. В силу своей высокой численности и быстрого размножения играет важную роль в пищевых цепях водоема, временами в некоторых водоемах может составлять сильную конкуренцию лещу и сиговым. В то же время он является основным пищевым объектом всех крупных хищных видов рыб - щуки судака, налима, окуня и угря. Хищники оказывают сдерживающее влияние на численность ерша, на качественный состав и структуру его популяций, кроме того они переводят малоценные виды рыб, к которым часто относят и ерша, в высококачественный продукт. Поэтому роль ерша в водоемах неоднозначна, и нет оснований считать его везде вредным и рекомендовать снижение его численности или даже уничтожение (Решетников и др. 2016).

3.5. Разработана математическая модель возникновения и развития биоценозов океанического обрастания в пелагиали. Показано, что сообщества обрастания являются удобными объектами моделирования при изучении закономерностей возникновения и функционирования биосистем, инвазий гидробионтов, применения биоиндикаторов и др. Представленные математические модели учитывают важнейшие взаимоотношения основных организмов обрастания (доминанты – ракообразные Lepadidae) в типичных для инвазии районах и глубинах при благоприятных и сравнительно постоянных абиотических факторах среды. В форме дифференциальных уравнений моделируется взаимодействие планктонных, оседающих на субстрат, личинок Lepas и Conchoderma (Lepadidae), обрастателей C. virgatum, L. anatifera, L. anserifera, L. hillii, наиболее распространённых хищников – крабов Planes minutus и рыб. В частности, моделируется поселение животных, «привлекательность» для них обрастателей, скорость поедания их разных возрастных групп хищниками. Вычислительные эксперименты показали, что скорость изменения плотности в разных возрастных группах Lepas и Conchoderma весьма отличается. Влияние пресса хищников на Conchoderma значительно выше, чем на Lepas. Важнейшее значение для динамики плотности обрастателей имеет их привлекающее влияние на циприсов и хищников в воде вблизи субстрата. Модели показали, что крабы и особенно рыбы – сильнейшие модификаторы биоценозов океанического обрастания, значительно сдерживающие рост количества обрастателей. При «исключении» рыб в вычислительных экспериментах количество Conchoderma резко увеличивается и становится близким по величине к количеству Lepas. Модели показали, что важнейшими факторами, лимитирующими океаническое обрастание, являются: скорость поселения на субстрате личинок Lepadidae, «привлекательность» обрастателей для хищников, поедание ими этих животных. Модели хорошо соотносятся с экспериментальными данными океанографических буйковых полигонов. Использование математических моделей для прогностических оценок инвазии обрастателей и дальнейшего развития их биоценозов весьма перспективно и не может быть заменено иными методами исследований (Iljin, Petrosyan  et al., 2013)

3.6. Проведен сравнительный анализ количественных характеристик древесно-кустарниковых кормов в активных и заброшенных поселениях на территории Приокско-Террасного заповедника в бассейне р. Таденка, где бобры обитают более 60 лет. С использованием однофакторного дисперсионного анализа по фактору типа поселения (активные, заброшенные) показано, что многолетнее кормодобывание в поселениях приводит к уменьшению видового богатства (P=0.068) древостоя,  Представлены различные гипотезы избирательного кормового воздействия бобров на различные ярусы растительного покрова (древостоя, подроста-подлеска) и  выявлены факторы, приводящие к разреживанию и изменению возрастной структуры древостоя и подроста-подлеска. Показано, что изменение видового состава, сопровождающееся увеличением доли мало поедаемых и непоедаемых видов. Сделан вывод о том, что если при первичном использовании полоса кормодобывания не превышала 50 м, то при многократном использовании поселения и при отсутствии хищников зона кормодобывания расширяется до 165 м. Этот вывод подтверждается на основе точного критерия Фишера (P=0.005), χ2 с поправкой Йетса (P=0.002), отношения правдоподобия (P=0.0002). При повторных заселениях в ранее использованные поселения с не восстановившимися кормовыми ресурсами в бассейне р. Таденки основным местом заготовки древесно-кустарниковых кормов становится удалённая зона в пределах от 50 до 165 м от берега(Goryainova et al 2014)

3.7. Разработано программное обеспечение комплексной имитационной модели, включающей проблемно-ориентированную базу данных многолетнего зимнего маршрутного учета (1961-2012 гг.) важнейших ресурсных видов, которое  предназначено для определения нормативов выделения квот и определения оптимальной структуры отстрела парнокопытных как на уровне отдельных охотничьих хозяйств, субъектов РФ, а также на федеральном уровне. На основе анализа данных мониторинга  млекопитающих ( 6 травоядных и 3 плотоядных )  в период 1981-2012 гг показано, что распад СССР сначала вызвал снижение численности животных(1991-2000), в первую очередь в результате чрезмерного использования, а затем рост численности животных с 2000г. После распада СССР численность волка  увеличилась более чем на 150% ( Bragina et al.,2015).

3.8. Проведен анализ многолетней динамики численности обыкновенного (речного) бобра (Castor fiber) и его поселений в бассейне р. Пушты и пойменных озёрах Мокши в юго-западной части Мордовского заповедника в 1940–2013 гг. Показано, что через 73 года после реинтродукции бобров количество их поселений и численность животных стабилизировались в диапазоне от 20 и 29 поселений и от 65 до 96 особей, соответственно. Проведенный комплексный анализ природных условий, климата, гидрологической сети, влияния хищников, болезней, пространственного размещения поселений, размеров занятых участков, количества плотин в поселениях, особенностей кормодобывания, запасов кормовых ресурсов, а также математическая обработка данных с помощью классических моделей популяционной динамики (Мальтуса, Бивертона-Холта и Рикера) и модели временных рядов позволяют утверждать, что динамика характеризуется климаксной стадией при флуктуации на низком уровне численности. Обсуждается гипотетическая – теоретическая качественная модель долговременной динамики численности бобровых популяций для разных скоростей восстановления кормовых ресурсов. В рамках этой модели показано, что динамика численности популяций на территории Березинского, Окского заповедников и национального парка Аллегейни характерна для высоких скоростей восстановления кормовых ресурсов (I тип динамики), а динамика численности для других популяций, обитающих на территории Лапландского, Ильменского, Печоро-Илычского и Мордовского заповедников – для низких скоростей восстановления кормовых ресурсов (II тип динамики). Утверждается, что дальнейшее развитие популяции в заповедниках в основном будет зависеть от функциональных (скорости восстановления кормов в заброшенных местообитаниях, масштабов и скорости развития черноольшаников на заброшенных бобровых поселениях) и случайных (морозных зим, зимних паводков и летних засух) факторов, оказывающих влияние на динамику бобровой популяции в заповеднике (Zavyalov et al, 2015).

3.9. Разработана оригинальная дискретная модель для анализа закономерностей динамики численности обыкновенного бобра (Castor fiber L.) после его вселения в Лапландский, Дарвинский, Приокско-Террасный, Центрально-Лесной, Окский и Хоперский заповедники, расположенные в северной, южной и центральной частях его ареала. Предложенная нами модель динамики численности расширяет наши знания о различных тенденциях динамики численности бобра после его реинтродукции. Ранее считалось, что в в таких случаях отмечается эруптивный тип динамики численности бобров. Однако наши исследования показали, что динамика численности обыкновенного бобра может быть описана с помощью 4 типов: эруптивный (Лапландский заповедник); одноступенчатый с квазипериодическим колебанием (Приокско-Террасный заповедник), многоступенчатый с квазипериодическими колебаниями (Дарвинский, Центрально-Лесной и Хоперский заповедники) и логистическим трендом изменения численности с периодическими колебаниями вокруг него (Окский заповедник) (Petrosyan et al., 2016).

3.10.Впервые с помощью специально разработанной процедуры, реализованной в среде ArcGis Desktop 10.4.1. проведен ретроспективный количественный анализ влияния средообразующей деятельности бобра на растительные сообщества бассейна р. Таденки, Приокско-Террасный заповедник, где бобры обитают более 65 лет. Показано, что избирательное кормодобывание бобра статистически значимо уменьшает (по критерию Тьюки) доли предпочитаемых бобрами видов деревьев в прибрежной 100-метровой зоне – береза (35%)>> осины (26%)>>липа (13%)=ива (11%) (P<0.05) и увеличивает доли непредпочитаемых видов – ольха (78%)>>сосна (65%)>>ель (30%) (P<0.05). Разработаны рекомендации для использования этой процедуры в средах других ГИС.

3.11. Исследованы механизмы влияния рыб на обилие мелких и крупных видов ветвистоусых ракообразных в мезокосмах с эвтрофными условиями. Показано, что рыбы смещали соотношение между обилием мелких и крупных видов ветвистоусых ракообразных в сторону увеличения количества мелких относительно контроля. Обогащение биогенными вещетвами, наоборот, смещало это соотношение в сторону крупных видов. Жизнедеятельность рыб и обогащение воды биогенными веществами приводили к статистически значимому повышению концентрации общего хлорофилла и хлорофилла синезеленых водорослей. При этом, не получено статистически значимого влияния рыб и обогащения воды биогенными веществами на общую биомассу ветвистоусых ракообразных и биомассу крупных видов из-за высоких дисперсий между повторностями. Тем не менее, средние значения биомасс свидетельствовали о влиянии рыб и обогащения биогенными веществами на общую биомассу и биомассу крупных видов ветвистоусых ракообразных (Фенева и др., 20016).

3.12.Мейотический драйв определяется как отклонение от менделевского наследования с превышением в потомстве  гетерозиготы частоты одного из двух вариантов гена. Этот генетический феномен может оказывать влияние на гаметогенез, фертильность, поведение, систему спаривания, выживание популяций и репродуктивную изоляцию. В последние годы мейотический драйв был открыт у представителей разных таксонов - растений, грибов и животных (насекомых, птиц, млекопитающих). Эволюционные и экологические аспекты этого феномена представлены в коллективной статье The Ecology and Evolutionary Dynamics of Meiotic Drive (Lindholm A.K., Petrosyan V.G., Safronova L.D. et all.), (Trends in Ecology and Evolution) 2016, V. 31, No. 4, P: 315-326.

 

  1. Изучение теоретических вопросов биологических инвазий

4.1. Проведен анализ данных об аллельном и генотипическом разнообразии украинских и армянских популяций партеногенетической ящерицы Darevskia armeniaca (4.1). На рисунке 4.2 показаны схемы двух моделей эволюции генотипов в популяциях D. armeniaca в Армении и на Украине (1963 г. Даревский И.С.,Щербак Н.Н.). Штриховкой показаны генотипы, образовавшиеся в украинской популяции и отсутствующие в популяциях Армении. Результаты моделирования показывают, что наиболее вероятной является модель Б – последовательного закрепления мутаций от генотипа к генотипу (Омельченко и др. 2016, РЖБИ).

13

Рис. 4.1. Локализация популяций D. armeniaca на Украине и в Армении: 1 – украинская (перемещённая) популяция, 2 – популяция «Семёновский перевал» (исходная) (показана чёрным квадратом), 3 – популяция «Папанино», 4 – популяция «Лчашен»,5 – популяция «Тэж», 6 – популяция «Кутчак», 7 – популяция «Алаверды», 8 – популяция «Степанаван», 9 – популяция «Пушкинский перевал», 10 – популяция «Медведь-гора», 11 – популяция «Артик», 12 – популяция «Лчап», 13 – популяция «Такярлу», 14 – популяция «Меградзор», 15 – популяция «Сотк».

 

14

 

Рис. 4.2. Филогенетические сети происхождения генотипов в случае гипотезы одновременного закрепления в популяциях возникших мутаций (А) и последовательного их закрепления (Б). Серым фоном закрашены генотипы, возникшие в популяции, интродуцированной на Украину. Пунктирной линией показаны наименее вероятные мутации (см. объяснение в тексте). Подписи над стрелками описывают мутации следующим образом: Локус_Номер исходного аллеляàНомер мутантного аллеля_(+)увеличение/(–)уменьшение GATA-кластера на n звеньев.

 

4.2. База данных: Чужеродные виды млекопитающих в экосистемах России: WEB-ориентированная информационно–поисковая система.Чужеродные виды млекопитающих в экосистемах России: WEB-ориентированная информационно–поисковая система

В БД включены материалы о 62 видах млекопитающих, обосновавшихся в новых регионах, в том числе и тех, ареалы которых в последние десятилетия стали сокращаться. При описании путей внедрения чужеродных видов млекопитающих в аборигенные экосистемы использованы 4 основные группы: преднамеренно интродуцированные, реинтродуцированные, саморасселяющиеся и случайно интродуцированные. База данных предназначена для: автоматизации сбора информации (систематизация материала, создание информационной основы для ГИС);  изучения разнообразия чужеродных млекопитающих на территории России и оценки степени «загрязнения» ими фауны России (как в целом, так и отдельных регионов); составления кадастров чужеродных видов для территорий различного масштаба; выяснения закономерностей распространения чужеродных видов на конкретной территории (выявление тенденций расселения и оценка участия в различных типах сообществ); оценки экологического влияния чужеродных видов; выбора показателей для разработки системы прогноза возможных инвазий и создания такой системы. БД предназначена для экологов, зоологов, ботаников и географов.

 

15

Рис. 4.3. Свидетельство о регистрации базы данных

4.4. Петросян В. Г., Дгебуадзе Ю. Ю., Рожнов В. В., Виноградова Ю. К., Кривошеина М. Г., Решетников А. Н., Хляп Л. А., Фенёва И.Ю., Озерова Н. А., Омельченко А. В., Горяйнова З.И., Дергунова Н. Н., Башинский И.В., Назаренко Е. А. База данных чужеродных видов растений, животных и микроорганизмов Российской Федерации в среде Biosystem office.

Созданная база данных (БД) включает материалы о чужеродных видах растений, животных и микроорганизов, обосновавшихся в новых регионах, в том числе и тех, ареалы которых в последние десятилетия стали сокращаться. БД предназначена для решения задач по следующим направлениям - изучение особенностей инвазионного процесса отдельных групп живых организмов; выявление основных инвазионных коридоров и векторов переноса чужеродных организмов; прогнозирование и предотвращение инвазий; оценка ущерба от инвазионных видов - экономический и социально-политический; пути и способы сокращения отрицательных последствий от инвазий, развитие информационного обеспечения (создание БД видам в разных отраслях народного хозяйства).

16

Рис. 4.4. Свидетельство о регистрации базы данных

ПУБЛИКАЦИИ

Статьи в рецензируемых периодических журналах (1997-2017 гг.)

Bragina, E.V. , Ives, A.R., Pidgeon, A.M., Kuemmerle, T., Baskin, L.M., Gubar, Y.P., Piquer-Rodriguez, M, Keuler, N.S., Petrosyan, V.G., Radeloff, V.C. Rapid declines of large mammal populations after the collapse of the Soviet Union. Conservation Biology, V. 29, Issue 3, 1 June 2015, Pages 844-853;

Dergunova N.N., Bulycheva T.I., Artemenko E.G., Shpakova A.P., Pegova A.N., Gemjian E.G., Dudnik O.A. A major nucleolar protein B23 as a marker of proliferation activity of human peripheral lymphocytes. Immunology Letters. Elsevier Science B.V. 2002. 83. стр. 67-72.

Dergunova N.N., Petrosyan V.G., Dgebuadze Y.Y. Priority targets for alien species control in Russia. J. Ecology and safety. 2012. V.6. p. 372-389

Dgebuadze Yu. Yu., Petrosyan V. G., Bessonov S. A., Dergunova S. A., Izhevsky S. S., Maslyakov V. Yu., Morozova O. V., Tsarevskaya N. G.. A general concept for development of a problem-oriented internet portal on alien species invasions in the Russian Federation. Russian Journal of Biological Invasions, 2010, Vol.1, № 2, p. 60-67.

Feniova I. Yu., Rzepecki M., Zilitinkevicz N. S., Kostrzewska-Szlakowska I., Krylov A. V., Majsak N. N., Petrosyan V. G., Razlutskij V. I., Dzialowski A. R. 2016. Experimental Impacts of Fish on Small and Large Cladocerans under Eutrophic Conditions. Inland Water Biology, 2016, Vol. 9, No. 4, pp. 375–381;

Goryainova, Z.I., Katsman, E.A., Zavyalov, N.A., Khlyap, L.A., Petrosyan, V.G. Evaluation of tree and shrub resources of the Eurasian beaver (Castor fiber L.) and changes in beaver foraging strategy after resources depletion. Russian Journal of Biological Invasions, 2014, 5 (4), pp. 242-254; http://link.springer.com/article/10.1134/S207511171404002X

Iljin I.N., Petrosyan V.G., Bessonov S.A., Dergunova, N.N. Modeling of the invasion and development of the pelagic communities of fouling organisms in the ocean. Russian Journal of Biological Invasions , 2013, 4 (4) PP. 225 – 233;

Lindholm A.K.,  Dyer K.A.,  Firman R.C.,  Fishman L., Forstmeier W. , Holman L., Johannesson H.,  Knief U.,  Kokko H.,  Larracuente A.M.,  Manser A., Montchamp-Moreau C., Varos G Petrosyan V.G.,  Pomiankowski A., Presgraves D.C.,  Safronova L.D.,  Sutter A.,  Unckless R.L.,  Verspoor R.L., Wedell N.,  Wilkinson G.S., Price T. AR. The Ecology and Evolutionary Dynamics of Meiotic Drive. Trends In Ecology & Evolution. 2016, V 31, I 4, P: 315-326;

Maktav D., Belchansky G.I., Sunar F., Petrosyan V.G. Coastal information system in Turkey: A case study in Koycegiz-Dalyan specially protected area // Исследование Земли из космоса. 1998. № 5. C. 55-64.

Malysheva D.N., Tokarskaya O.N., V.G. Petrosyan, F.D. Danielyan, I.S. Darevsky, A.P. Ryskov. Genomic variation in parthenogenetic lizard Darevskia armeniaca: evidence from DNA fingerprinting data. Journal of Heredity, 2007. 98(2):173-178.

Malysheva D.N., Tokarskaya O.N., V.G. Petrosyan, F.D. Danielyan, I.S. Darevsky, A.P. Ryskov. Genomic variation in parthenogenetic lizard Darevskia armeniaca: evidence from DNA fingerprinting data. J. Heredity, 2006 (in press).

Omelchenko, A.V., Girnyk, A.E., Osipov, F.A., Vergun, A.A., Petrosyan, V.G., Danielyan, F.D., Arakelyan, M.S., Ryskov, A.P. Genetic Differentiation among Natural Populations of the Lizard Complex Darevskia raddei as Inferred from Genome Microsatellite Marking. Russian Journal of Genetics, 2016, Vol. 52, No. 2, pp. 231–235.);

Omelchenko, A.V., Girnyk, А.Е., Osipov, F.А., Petrosyan, V.G., Vergun, А.А. and Ryskov, А.P. Detection of genotypic changes in the parthenogenetic lizards of Darevskia armeniaca (Mehely) introduced from Armenia to Ukraine. Russian Journal of Biological Invasions, 2016, Vol. 7, No. 3, pp. 275–282.

Petrosyan V. G.,  Golubkov V. V.,  Goryainova Z. I.,  Zav’yalov N. A.,  Al’bov S. A.,  Khlyap L. A.,  Dgebuadze Yu. Yu. Modeling of the Eurasian Beaver (Castor fiber L.) Population Dynamics in the Basin of a SmallOkaRiver Tributary, the TadenkaRiver (Prioksko Terrasnyi Nature Reserve). Russian Journal of Biological Invasions. Russian Journal of Biological Invasions 2013, 4 (1) PP. 45 – 53,

Petrosyan V.G., Golubkov V.V., Zavyalov N.A., Goryainova Z.I., Dergunova N.N., Omelchenkо A.V., Bessonоv S.A., Albov S.A., Marchenko N.F., Khlyap L.A. Patterns of population dynamics of Eurasian beaver (Castor fiber L.)after reintroduction into nature reserves of European part of Russia. Russian Journal of Biological Invasions, 2016, Vol. 7, No. 4, pp. 355—373.,

Ryskov A.P., Osipov F.A., Omelchenko A.V., Semyenova S.K., Girnyk A.E., Korchagin V.I., Vergun A.A., Murphy R.W. (2017) The origin of multiple clones in the parthenogenetic lizard species Darevskia rostombekowi // PLoS ONE 12(9): e0185161. https: //doi.org/10.1371/journal.pone.0185161.

Tokarskaya O.N., Petrosyan V.G., Kan N.G., Martirosyan I.A., Darevsky I.S., Ryskov A.P. Genetic variation partenogenenetic caucasian rock lizads of genus Lacerta (L. dahli, L.armeniaca, L. unisexualis) analyzed by DNA fingerprinting. Mol. Gen Genet. 2001. 265. 812-819.

Tokarskaya O.N., Petrosyan V.G., Kashentseva T.A., Riskov A.P. Analysis of relatadness and genetic diversity in Sibirian Cranes Grus leucogerranuc by DNA fingerprinting // Vogelwelt. 1999. № 20. P. 383-389.

Vergun A.A., Martirosyan I.A., Semyenova S.K., Omelchenko A.V., Petrosyan V.G., Lazebny, O.E., Tokarskaya O.N., Ryskov, A.P. Clonal Diversity and Clone Formation in the Parthenogenetic Caucasian Rock Lizard Darevskia Dahlia. PLoS ONE. 2014,9(3), PP. 1-9; e91674. doi:10.1371/journal.pone.0091674

Zavyalov N. A., Artaev O. N., Potapov S. K., Petrosyan V. G. Beavers (Castor fiber) of the Mordovskii Nature Reserve: Population Development History, Current State, and Prospects. Russian Journal of Biological Invasions, 2015, Vol. 6, No. 3, pp. 148–164

Zinovieva S. V. ,  Butorina N. N.,  Udalova Zh. V.,  Khasanova O. S., Filimonova L. V. , Petrosyan V. G., Pel’gunov A. N. World Collections of Parasitic Worms. Biology Bulletin. 2015. V. 42, № 6, p. 540-545;

Бельчанский Г.И., Петросян В.Г., Алпацкий И.В. Исследование зависимости сезонных перемещений самок белых медведей от репродуктивного статуса. ДАН. 2001. 379. 6. стр. 830-833

Бельчанский Г.И., Петросян В.Г., Гарнер Г., Дуглас Д. Изучение пространственно-временной динамики параметров местообитания белых медведей и характера использования ресурсов по данным космического мониторинга // Успехи соврем. биологии. 1998. Т. 118, № 2. С. 227-240.

Бельчанский Г.И., Петросян В.Г., Гарнер Г.У. Изучение экологии белого медведя (Ursus maritimus) в Российской Арктике по данным спутниковой биотелеметрии // Успехи соврем. биологии. 1997. Т. 117, № 3. С. 336-345.

Бельчанский Г.И., Петросян В.Г., Гарнер Г.У. Некоторые региональные аспекты экологии географических группировок белых медведей (Ursus maritimus) Российской Арктики по данным космического мониторинга // Успехи соврем. биологии. 1999. Т. 119, № 6. С. 607-621.

Дергунова Н. Н., Шпакова А.П., Дейнеко Н.Л., Гемджан Э.Г., Булычева Т.И. Митогенное и токсическое действие фитогемагглютинина на лимфоциты периферической крови человека в культуре. Иммунология. Медицина. 2003. 24. 4. стр. 205-208.

Завьялов Н.А., Альбов С.А., Петросян В.Г., Хляп Л.А., Горяйнова З.И. Инвазия средообразователя – речного бобра (Castor fiber L.) в бассейне р. Таденки (Приокско-Террасный заповедник) // Российский журнал биологических инвазий. 2010. №3. С. 39-61

Кан Н.Г., Петросян В.Г., Мартиросян И.А., Рысков А.П., Даревский И.С., Даниелян Ф.Д, Рябинин Д.М, Гречко В.В., Токарская О.Н. ДНК фингерпринтинг партеногенетического вида ящериц Lacerta dahli: выявление геномного полиморфизма мини- и микросателлитных локусов // Молекулярная биология. 1998. Т. 32, № 5. С. 805-812.

Корчагин В.И., Мартиросян И.А., Омельченко А.В., Даревский И.С., Рысков А.П., Токарская О.Н. Изучение аллельного полиморфизма (GATA)n-содержащих локусов партеногенетических ящериц Darevskia unisexualis (сем. Lasertidae). // Генетика, 2004, том 40, №10, с. 1336-1342 (Korchagin, V.I., Martirosyan, I.A., Omelchenko, A.V. (2004) Study of allelic polymorphism of (GATA)n-containing loci in parthenogenetic lizards Darevskia unisexualis (Lacertidae). Russian Journal of Genetics. 40(10): 1095–1101.).

Курченко Е.И., Петросян В.Г., Ермакова И.М., Сугоркина Н.С. Многолетняя динамика пойменного луга: количественная характеристика флористического разнообразия. Ботанический журнал. 2010. Том. 95. вып. 7, с. 911-924.

Малышева Д.Н., Даревский И.С., Токарская И.С., Петросян В.Г., Мартиросян И.А., Рысков А.П. Изучение генетической изменчивости у однополых и двуполых видов ящериц Юго-Восточной Азии рода Leiolepis. Генетика. 2006. 42. 581-586.

Малышева Д.Н., Токарская И.С., Петросян В.Г., Ф.Д. Даниелян, И.С. Даревский, Рысков А.П. Генетическая дифференциация партеногенетических ящериц Darevskia rostombekovi (сем. Lacertidae) по данным ядерных и митохондральных маркеров ДНК. ДАН. 2006. 410. 4. 560-563.

Мартиросян И.А., Кан Н.Н., Петросян В.Г., Д.Н. Малышева, А.А. Трофимова, Даниелян Ф.Д., Даревский И.С., Корочкин Л.И., Рысков А.П., Токарская О.Н. Фингерпринтный анализ вариабельности мини- и микросателлитных повторов ДНК у партеногенетических ящериц Darevskia armeniaca // Генетика. 2003. т. 39. № 2. C. 215-222.

Мартиросян И.А., Рысков А.П., Петросян В.Г., Аракелян М.С., Асланян А.В., Даниелян Ф.Д., Даревский И.С., Токарская О.Н. Изменчивость мини- и микросателлитных маркеров ДНК в популяциях партеногенетической скальной ящерицы Darevskia rostombekovi // Генетика. 2002. Т. 38, № 6. С. 828-835.

Омельченко А.В., Гирнык А.Е., Осипов Ф.А., Вергун А.А., Петросян В.Г., Даниелян Ф.Д., Аракелян М.С., Рысков А.П. Генетическая дифференциация природных популяций ящериц комплекса Darevskia raddei по данным микросателлитного маркирования геномов  // Генетика. − 2016. – Т. 52 − № 2. – С. 260−264.

Омельченко А.В., Гирнык А.Е., Осипов Ф.А., Петросян В.Г., ВергунА.А., Рысков А.П. Выявление генотипических изменений у партеногенетических ящериц Darevskia armeniaca (Mehely), интродуцированных из Армении на Украину // Российский журнал биологических инвазий. − 2016. – № 2. – С. 102−105.

Омельченко А.В., Корчагин В.И. Термодинамическая характеристика ди-, три- и тетрануклеотидных микросателлитных локусов у партеногенетических ящериц Darevskia unisexualis. // Генетика 2009. Т. 45, № 8, 1143-1147 (Omelchenko, A.V., Korchagin, V.I. (2009) Thermodynamic characteristization of di-, tri-, and tetranucleotide microsatellite loci in parthenogenetic lizards Darevskia unisexualis. Russian Journal of Genetics. 45(8): 1004–1008.);

Омельченко А.В., Корчагин В.И., Севастьянова Г.А., Рысков А.П., Токарская О.Н. Молекулярно-генетическая характеристика микросателлитных динуклеотидных локусов у партеногенетических ящериц Darevskia unisexualis. // Генетика, 2009, том 45, №2, с. 230-238 (Omelchenko, A.V., Korchagin, V.I., Sevast’yanova, G.A., Ryskov, A.P., Tokarskaya, O.N. (2009) Molecular genetic characteristic of dinucleotide microsatellite loci in parthenogenetic lizards Darevskia unisexualis. Russian Journal of Genetics. 45(2): 203–210.).

Осипов Ф.А., Вергун А.А., Гирнык А.Е., Кутузова Н.М., Рысков А.П. Молекулярно-генетическая характеристика аллельных вариантов микросателлитных локусов Du281, Du215 и Du323 у партеногенетических ящериц Darevskiarostombekovi (сем. Lacertidae) // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. − 2016. – № 2. – С. 58−62.

Петросян В.Г. Принципы и методы оценки разнообразия биологических систем на разных уровнях иерархии с применением Biosystem 96 // Изучение и охрана разнообразия фауны, флоры и основных экосистем Евразии. М.: Наука, 2000. С. 244-256.

Петросян В.Г. Развитие методов оценки динамики обилия и оптимальной плотности крупных растительноядных млекопитающих // Мониторинг биоразнообразия. М.: Наука, 1997. С. 172-178.

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А. Комплексная имитационная модель оценки динамики численности, половозрастной структуры и оптимальной плотности лося (Alсes alсes L.) на основе данных наземных и дистанционных измерений // Успехи современной биологии. 2010, т. 130. № 1. С. 88-99.

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Назарова К.А., Омельченко А. В. Оценка динамики численности и половозрастной структуры лося (A. Alces L.) в России с использованием имитационной модели и данных многолетнего мониторинга. Ж. Известия Самарского научного центра РАН, № 11, 1(7), 2009, с. 1566-1574

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Омельченко А.В.  Моделирование динамики численности, оценка и сравнительный анализ демографических параметров популяций лося в России и Финляндии с использованием данных многолетнего мониторинга. Ж. Математическая биология и биоинформатика. 2012. Т. 7. № 1. С. 244 –256.;http://www.matbio.org/2012/Petrosyan2012%287_244%29.pdf;

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Омельченко А.В. Анализ динамики численности и пространственного распределения важнейших ресурсных видов диких копытных (лося, косули, кабана) России на основе данных многолетнего мониторинга. Ж. Успехи современной биологии. 2012. Т. 132. № 5 С. 463-476;

Петросян В.Г., Павлов А.В., Бессонов С.А., Хабарова Е.И.. Информационные системы и WEB-порталы по разнообразию видов и экосистем. Ж. Безопасность жизнедеятельности. Ж. Безопасность жизнедеятельности. Т. №12, вып. 84 2007, с. 49-51.

Петросян В.Г., Токарская О.Н., Данилкин А.А., Рысков А.П. Количественный анализ генетических параметров популяций европейской (Capreolus capreolus L.) и сибирской (C. pygargus Pall.) косуль на основе RAPD-маркеров // Генетика. 2002. Т. 38, № 6. С 812-819.

Петросян В.Г., Токарская О.Н., Кашенцева Т.А., Корочкин Л.И., Рысков А.П. Оценка подразделенности популяций на основе данных ДНК-фингерпринтинга и модифицированной F-статистики Райта // Генетика. 2003. Т. 39, № 2. С. 229-235.

Петросян В.Г., Токарская О.Н., Малышева Д. Н., Рысков А. П. Количественная оценка генного разнообразия и межпопуляционной дифференциации партеногенетических видов рода Darevskia на основе мини и микросателлитных маркеров ДНК // Генетика. 2003. Т. 39, № 10. С. 1418-1426.

Рысков А. П., Кан Н.Н., Мартиросян И. А., Даревский И.С., Даниелян Ф.Д., Петросян В.Г., Токарская О.Н. Повышенная варибельность (TCC)n - микросателлитных локусов в популяциях партеногенетического вида ящериц Lacerta unisexualis Darevsky // Генетика. 2000. Т. 36, № 11. С. 1501-1506.

Сафронова Л.Д., Петросян В.Г., Орлов В.Н. Характеристика частоты носителей t- гаплотипов в природных популяциях домовых мышей (Mus musculus) // Генетика. 2010. Т. 46. №5. С. 659-667.

Сафронова Л.Д., Потапов С.Г., Петросян В.Г. Применение t–специфичных микросаттелитных маркеров ДНК для определения филогенетической связи грызунов рода Mus. Ж. Генетика, 2009. T. 45. № 5 с. 662-669.

Токарская О.Н., Даревский И.С., Мартиросян И.А., Бадаева Т.Н., Корочкин Л.И., Даниелян Ф.Д., Петросян В.Г., Рысков А.П. Генетическая нестабилность (GATA)n микросателлитных повторов ДНК и соматический мозаицизм у однополых ящериц Darevskia unisexualis // ДАН. 2003. Т. 388, № 6. С. 825-828.

Токарская О.Н., Ефремова Д.А., Кан Н. Г., Данилкин А.А., Семпере А., Петросян В.Г., Семёнова С.К., Рысков А.П. Изменчивость мультилокусных маркеров ДНК в популяциях cибирской (Capreolus pygargus Pall.) и европийской (C. capreolus L.) косуль // Генетика. 2000. Т. 36, №11. С. 1520-1529.

Токарская О.Н., Кан Н.Н., Петросян В.Г., Мартиросян И.А., Даревский И.С., Даниелян Ф.Д., Гречко В.В., Рябинин Д.М., Рысков А.П. Вариабельность GATA-микросателлитных ДНК в популяциях партеногенетического вида ящериц Lacerta unisexualis // Генетика. 2000. Т. 36, № 5. С. 693-698.

 

 

Монографии, главы в монографиях и учебники (1997-2017 г.)

Альбов С.А., Андреева М.В., Башинский И.В., Голубков В.В., Горяйнова З.И., Дгебуадзе Ю.Ю., Завьялов Н.А., Кацман Е.А., Крылов А.В., Онипченко В.Г., Прокин А.А., Петросян В.Г., Хляп Л.А. Речной бобр как ключевой вид экосистемы малой реки (на примере Приокско-Террасного государственного биосферного природного заповедника) /Ред. Дгебуадзе Ю.Ю., Завьялов Н.А., Петросян В.Г. – М: Т-во научных изданий КМК, 2012. – 150 с.

Информационные системы по разнообразию видов и экосистем. Материалы международного симпозиума. Редакторы издания: академик РАН Павлов Д.С., член-корр. РАН Дгебуадзе Ю.Ю., д.б.н. Петросян В.Г. Товарищество научных изданий КМК. 2006. 261 c.

Клональное разнообразие и механизмы его формирования у однополых видов ящериц рода Darevskia : Монография / А. А. Вергун, А. Е. Гирнык, Ф. А. Осипов, А. В. Омельченко. – Москва : МПГУ, 2016. – 96 с.

Омельченко А.В. Молекулярная характеристика локусов, сожержащих динуклеотидные микросателлиты, генома партеногенетической ящерицы  Darevskia unisexualis: Монография.-М.: Издательство  “Прометей” МПГУ, 2013. – 102 с. ISBN 978-5-7042-2456-3

Петросян В.Г., Павлов А.В., Бессонов С.А., Назаренко Е.А., Ильин И.Н. Комплекс информационных систем и баз данных по инвентаризации биологических ресурсов. Фундаментальные основы управления биологическими ресурсами. Редакторы издания: член-корр. РАН Л.П. Рысин, проф. Стриганова Б.Р, проф. Шатуновский М.И., д.б.н. Петросян В.Г. Товарищество научных изданий КМК. 2005. с. 23-34.

Петросян В.Г., Токарская О.Н., Кащенцева Т.А., Рысков А.П. Оценка подразделенности изолированных популяций сибирского журавля на основе данных ДНК-фингерпритинга. Эволюционные факторы формирования разнообразия животного мира. Редакторы издания : академик Воробьева Э.И., д.б.н., проф. Стриганова Б.Р. Товарищество научных изданий КМК. 2005. с. 275-282.

Решетников Ю.С., Попова О.А., Кияшко В.И., Дгебуадзе Ю.Ю., Акимова Н.В., Москалькова К.И., Бобырев А.Е., Михеев В.Н., Петросян В.Г., Болотова H.Л, Буцкая Н.А., Голованов В.К., Жохов А.К., Лукин А.А., Селюков А.Г., Касумян А.О., Марусов Е.А., Сидоров С.С. Обыкновенный ёрш Gymnocephalus cermius (Linnaeus, 1758). Систематика, морфология, образ жизни и роль ерша в экосистемах (Ред.: Ю.С. Решетников, О.А. Попова). М.: Тов-во научных изданий КМК, 2016. 279 с.

Рыбы в заповедниках России. В двух томах. Т.1. Пресноводные рыбы. Ред. Коллегия. Ю.Ю. Дгебуадзе Ю.Ю., Д.С. Павлов, В.Г. Петросян, Ю.С. Решетников. М: Т-во научных изданий КМК, 2010. – 627 с. , 400 экз.

Рыбы в заповедниках России. В двух томах. Т.2. Морские рыбы. Ред. Коллегия. Ю.Ю. Дгебуадзе Ю.Ю., Д.С. Павлов, В.Г. Петросян, Ю.С. Решетников. М: Т-во научных изданий КМК, 2013. – 673 с. , 400 экз.

Статьи в книгах и сборниках (1997-2017 г.)

Dgebuadze Yu.Yu., Dergunova N.N., Khlyap L.A., Petrosyan V.G. Risk assessment of invasion of alien species into European part of Russia using information systems. IV International symposium “Invasion of alien species in Holartic” (borok-4), Programme & book of abstracts. 2013, p. 40.

Goryainova Z. I., Petrosyan V. G., Zavyalov N. A. GIS and Remote Sensing Data for Evaluation of the Eurasian Beaver (Castor fiber) Activity in Russian Natural Protected Areas. Book of abstract. 17-20 September 2012, 6th International Beaver Symposium. Faculty of forestry, University of Zagreb, Croatia, 2012. P. 89.

Goryainova Z.I., Petrosyan V.G., Zavyalov N.A. Assessment of beaver’s (Castor fiber L.) building activity using GIS and remote sensing data . IV International symposium “Invasion of alien species in Holartic” (borok-4), Programme & book of abstracts. 2013, p/ 64.

Khlyap L. A., An. A. Varshavsky, Al. A. Varshavsky, V. G. Petrosyan, A. V. Omel'chenko Mammal diversity in Transbaikalia and some aspects of its dynamics as a result of anthropogenic impact // Ecological consequences of biosphere processes in the ecotone zone of Southern Siberia and Central Asia: Ulaanbaatar: Bembi san Publishing House, 2010. P. 195-198.

Osipov F., Vergun A., Ryskov A. Clonal variation in the parthenogenetic lizard species Darevskia rostombekowi (Lacertidae) // Book of Abstracts of 9th Symposium on the Lacertids of the Mediterranean Basin & 1st Symposium on Mediterranean Lizards. − Lemesos (Limassol), Cyprus. − 20−23 June 2016.− P. 29.

Petrosyan V.G., Dergunova N.N., Bessonov S.A., Omelchenko A.V. Мodeling the dynamics of populations size and comparative analysis of the demographic parameters (sexual and age structure) of moose in the Russia and Finland using long-term monitoring data. Book of abstract. 7th International Moose Symposium, 6-10 August 2012, Bialowieza, Poland. Mammal Research Institute of the PolishAcademy of Sciences P. 53-54.

Petrosyan V.G., Golubkov V.V., Goryainova Z.I., Zavyalov N.A., Albov S.A., Khlyap L.A., Dgebuadze Y.Y.. Quasi-periodic fluctuations of European beavers (Castor fiber L.) abundance in the Prioksko-Terrasny Nature Reserve . IV International symposium “Invasion of alien species in Holartic” (borok-4), Programme & book of abstracts. 2013, p. 140.

Petrosyan V.G., Golubkov, V.,V., Goryainova, Z., I., Zavyalov, N., A., Albov, S., A., Khlyap, L., A., Dgebudze, Y., Y. Modeling of Eurasian Beavers (Castor fiber L.) Population Dynamics in TadenkaRiver Basin (Prioksko-Terrasnyi Nature Biosphere Reserve). Book of abstract. 17-20 September 2012, 6th International Beaver Symposium. Faculty of forestry, University of Zagreb, Croatia, 2012. P. 27.

Zavyalov N.A., Albov S.A., Khlyap L.A., Petrosyan V. G., Goryainova Z. I. Long-term population dynamics and ecosystem engineering of Eurasian beaver (Castor fiber) in Tadenka River basin (Prioksko-Terrasny nature biospher reserve, Central russia). Book of abstract. 17-20 September 2012, 6th International Beaver Symposium. Faculty of forestry, University of Zagreb, Croatia, 2012. P.129.

Гирнык А.Е., Осипов Ф.А., Омельченко А.В., Вергун А.А. Генетические процессы на молекулярном, организменном и популяционном уровнях организации у кавказских скальных ящериц Darevskia valentini по данным молекулярного маркирования геномов // Тезисы докладов VI Съезда Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС) и ассоциированные генетические симпозиумы. – Ростов-на-Дону, 15–20 июня 2014 г.− C. 21.

Гирнык А.Е., Осипов Ф.А., Омельченко А.В., Вергун А.А. Использование микросателлитных маркёров для популяционно-генетического анализа партеновида Darevskia armeniaca // Тезисы XXVI Зимней молодёжной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». − Москва, 10–14 февраля 2014 г.− C. 41.

Гирнык А.Е., Осипов Ф.А., Омельченко А.В., Корчагин В.И., Кутузова Н.М., Вергун А.А. Молекулярно-генетическая характеристика микросателлитного локуса Du215 у однополого вида ящериц Darevskia armeniaca (сем. Lacertidae) // Труды научной конференции и круглого стола, посвященные приоритетным исследованиям в области естественных наук. Сборник материалов. − М.: МПГУ, 2014 − С. 96−98.

Горяйнова З.И. , Петросян В.Г., Завьялов Н.А., Панкова Н.Л. Модели динамики численности локальных популяций речного бобрА (Castor fiber L.). // Математическое моделирование в экологии. Материалы Второй Национальной конференции с международным участием, 23-27 мая 2011 г.- Пущино, ИФХиБПП РАН. C. 78-80.

Горяйнова З.И., Петросян В.Г. Потенциальные возможности космических снимков низкого (Landsat), среднего (IKONOS) и высокого (GeoEye) разрешения для картирования объектов жизнедеятельности бобров на примере заповедников России. Материалы XII Международной научно-практической экологической конференции «Структурно-функциональные изменения в популяциях и сообществах на территориях с разным уровнем антропогенной нагрузки», Белгородский государственный национальный исследовательский университет, г. Белгород, 9-12 октября 2012 г. с. 42.

Горяйнова З.И., Петросян В.Г. Сравнительный анализ динамики численности и демографических параметров локальных популяций речного бобра (Castor fiber L.) особо охраняемых природных территорий на основе классических моделей популяционной динамики. Материалы XII Международной научно-практической экологической конференции «Структурно-функциональные изменения в популяциях и сообществах на территориях с разным уровнем антропогенной нагрузки», Белгородский государственный национальный исследовательский университет, г. Белгород, 9-12 октября 2012 г. с. 43.

Горяйнова З.И., Петросян В.Г., Завьялов Н.А. Картирование объектов Жизнедеятельности бобра (Castor fiber) на основе данных дистанционного зондирования. В кн. “Актуальные проблемы экологии и природопользования”. Сборник научных трудов. Изд. РУДН, 2013. с. 20-23.

Дергунова Н.Н., Петросян В.Г., Омельченко А.В., Бессонов С.А. Нагорная Е.Г. Оценка репрезентативности особо охраняемых природных территорий для сохранения таксономического и ландшафтного разнообразия России. Сборник материалов конференции “Экология, эволюция и систематика животных”, 2009 г., Изд. НП Голос губернии, Рязань, 2009, с. 382-384.

Ермакова И.М., Сугоркина Н.С., Курченко Е.И., Петросян В.Г. Использование фактографических информационных систем для анализа динамики флористического разнообразия и структуры Залидовских пойменных лугов (Калужская обл.) на основе многолетнего мониторинга. В кн. Научные труды Московского педагогического государственного университета. Физико-математические и естественные науки. Сборник статей. –М. “Прометей” МПГУ, 2007 – с. 266-271

Ильин И.Н., Петросян В.Г., Бессонов С.А. Модельное прогнозирование колонизации новых местообитаний организмами океанического обрастания и развития их биоценозов. В кн. Математическое моделирование в экологии, Изд., ИБХиБПБ РАН, 2013, с. 128-129

Ильин И.Н., Петросян В.Г., Бессонов С.А., Дергунова Н.Н. Концептуальное моделирование возможностей вселения морских моллюсков-древоточцев в воды России и сопредельных стран. В. кн. “Водные экосистемы: трофические уровни и проблемы поддержания биоразнообразия”, Материалы международной конференции “Водные и наземные экосистемы: проблемы и перспективы исследований”. Вологда, ООО Центр оперативной печати “Коперник”,2008. с. 165-168.

Омельченко А.В. Математическое моделирование генетико-популяционных процессов на основе полиморфизма микросателлитных последовательностей ДНК партеногенетических ящериц Darevskia unisexualis. // Актуальные проблемы приоритетных направлений развития естественных наук: Сборник статей. – М.: Издательство  “Прометей” МПГУ, 2008. С. 163-168.

Омельченко А.В., Вергун А.А., Петросян В.Г., Корчагин В.И., Токарская О.Н. Модель гентико-популяционной структуры партеногенетического вида кавказской скальной ящерицы Darevskia unisexualis на основе многомерного анализа// Математическое моделирование в экологии / Материалы Второй Национальной конференции с международным участием, 23-27 мая 2011 г.- Пущино, ИФХиБПП РАН, 2011.– С. 195-197.

Омельченко А.В., Вергун А.А., Петросян В.Г., Рысков А.П. Моделирование динамики генофондов популяций кавказских скальных ящериц рода Darevskia на основании данных молекулярного маркирования геномов. В кн. Математическое моделирование в экологии. Сборник научных трудов. Изд. ИБХиБПБ РАН, 2013, с. 191-194

Омельченко А.В., Вергун А.А., Петросян В.Г., Токарская О.Н. Модели генетико-популяционной структуры партеногенетического вида кавказских скальных ящериц Darevskiau nisexualisна основе данных молекулярного маркирования геномов // В. кн. «Биологическое разнообразие и проблемы охраны фауны Кавказа», Ереван, Армения. – Ер.: Асогик, 2011. – С. 224-227.

Омельченко А.В., Корчагин В.И., Бадаева Т.Н., Малышева Д.Н., Мартиросян И.А., Рысков А.П. Геномная нестабильность и генетическое разнообразие у клонально размножающихся ящериц рода Darevskia. // Достижения и проблемы генетики, селекции и биотехнологии. - Т.1 - Киев: Логос, 2007. – С. 256-260.

Омельченко А.В., Корчагин В.И., Севастьянова Г.А., Токарская О.Н. Полиморфизм микросателлитных динуклеотидных локусов у партеногенетических ящериц Darevskia unisexualis. // Доклады академии наук, 2009, том 424, №1, с. 122-124 (Omelchenko, A.V., Korchagin, V.I., Sevast’yanova, G.A., Tokarskaya, O.N. (2009) Polymorphism of microsatellite dinucleotide loci in parthenogenetic lizards Darevskia unisexualis. Doklady Biochemistry and Biophysics. 424: 5–7.);

Омельченко А.В., Осипов Ф.А., Гирнык А.Е., Корчагин В.И., Кутузова Н.М., Вергун А.А. Создание математической модели генетико-популяционной структуры партеновидов // Труды научной конференции и круглого стола, посвященные приоритетным исследованиям в области естественных наук. Сборник материалов. − М.: МПГУ, 2014 − С. 93−95.

Осипов Ф.А, Гирнык А.Е., Вергун А.А., Омельченко А.В. Изменения генетико-популяционной структуры и мутационные процессы в гипервариабельных локусах геномов при интродукции популяций кавказской скальной ящерицы Darevskia armeniaca из Армении на Украину // Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2015» / Отв. ред. А.И. Андреев, А.В. Андриянов, Е.А. Антипов. [Электронный ресурс] − М.: МАКС Пресс, 2015. − 1 электрон. опт. диск (DVD-ROM); 12 см.

Осипов Ф.А., Вергун А.А. Методика проведения полимеразных цепных реакций // Труды научной конференции и круглого стола, посвященные приоритетным исследованиям в области естественных наук. Сборник материалов. − М.: МПГУ, 2014 − С. 75−78.

Осипов Ф.А., Вергун А.А. Определение клональных линий гибридного и мутационного происхождения в популяциях партеновида Darevskia rostombekowi // Современные проблемы биологической эволюции: материалы III Международной конференции, к 130-летию со дня рождения Н. И. Вавилова и 110-летию со дня основания Государственного Дарвиновского музея. − Москва, 16–20 октября 2017 г.− C. 144−146.

Осипов Ф.А., Гирнык А.Е., Вергун А.А., Омельченко А.В. Генетическая дифференциация комплекса ящериц Darevskia raddei на основании данных микросателлитного анализа // Тезисы XXVII Зимней молодёжной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». − Москва, 9–12 февраля 2015 г.− C. 32.

Осипов Ф.А., Гирнык А.Е., Севастьянова Г.А., Кутузова Н.М., Омельченко А.В., Вергун А.А., Рысков А.П. Генотипическое разнообразие клонально размножающихся рептилий Darevskia rostombekovi // Тезисы XXVI Зимней молодёжной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». − Москва, 10–14 февраля 2014 г.− C. 18.

Павлов Д.С., Петросян В.Г., Дгебуадзе Ю.Ю., Бессонов С.А. Методологические основы создания информационной системы по разнообразию видов особо охраняемых природных территорий России в глобальной сети Интернет. В кн. Заповедники России и устойчивое развитие. Великие Луки, 2007. ЦЛГПЗ. с. 124-136

Петросян В.Г. Бессонов С.А., Назаренко Е.А., Пачин Ю.В., Назарова К.А. Комплексная модель оценки кормовой фитопродуктивности лесных фитоценозов, оптимальной плотности и динамики численности копытных животных. В кн. Заповедники России и устойчивое развитие. Великие Луки, ЦЛГПЗ. 2007. с. 87-99

Петросян В.Г., Бессонов С.А., Дергунова Н.Н. Зональная репрезентативность и таксономическое разнообразие особо охраняемых природных территорий России. В. кн. “Организмы, популяции, экосистемы: проблемы и пути сохранения биоразнообразия”, Материалы международной конференции “Водные и наземные экосистемы: проблемы и перспективы исследований”. Вологда, ООО Центр оперативной печати “Коперник”, 2008. с.302-307.

Петросян В.Г., Бессонов С.А., Дергунова Н.Н., Омельченко А.В. Анализ динамики численности и оценка доступных кормовых ресурсов охотничье-промысловых видов парнокопытных животных России с использованием данных наземных и дистанционных измерений. «Видовые популяции и сообщества в антропогенно трансформированных ландшафтах: состояние и методы его диагностики», 20-25 сентября 2010 года, г. Белгород, Белгородский государственный университет. С. 11-13.

Петросян В.Г., Бессонов С.А., Омельченко А.В. Математическое моделирование динамики численности и определение демографических параметров популяции лося (Alсes alсes L.) на основе данных многолетнего мониторинга. В. кн. Математика и реальность: конфронтация строгости и сложности. Изд. Солитон. 2012. 458 – 472

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Назарова К.А Оценка качества среды обитания, кормовой емкости и оптимальной плотности копытных животных России на основе наземных и дистанционных данных. В. кн. “Организмы, популяции, экосистемы: проблемы и пути сохранения биоразнообразия”. Материалы международной конференции “Водные и наземные экосистемы: проблемы и перспективы исследований”. Вологда, ООО Центр оперативной печати “Коперник”, 2008. с. 227-233.

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Омельченко А.В. WEB-ориентированная информационная система по разнообразию видов и экосистем особо-охраняемых природных территорий России на основе данных наземных и дистанционных измерений. Проблемы мониторинга природных процессов на особо охраняемых природных территориях», посвященной 75-летию Хоперского заповедника, 20-23 сентября 2010 г., с.206-209.

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Омельченко А.В. Методологические основы создания локальной и глобальной версий информационных систем по разнообразию видов особо охраняемых природных территорий России. Материалы 15-ого Международного научно-промышленного форум «ВЕЛИКИЕ РЕКИ». Нижний Новгород. Изд. ННГАСУ, с. 16-22

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Омельченко А.В. Модели динамики численности и пространственного распределения важнейших ресурсных видов диких копытных России на основе данных многолетнего мониторинга. Математическое моделирование в экологии // Материалы Второй Национальной конференции с международным участием, 23-27 мая 2011 г.- Пущино, ИФХиБПП РАН (ISBN 978-5-904386-14-2), 2011.с. 205-207.

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Омельченко А.В. Применение матричной-имитационной модели для выбора различных стратегий управления популяциями важнейших ресурсных видов парнокопытных России. В кн. Математическое моделирование в экологии. Сборник научных трудов. Изд., ИБХиБПБ РАН, 2013, с. 199-201

Петросян В.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А., Омельченко А.В., Варшавский А. А., Хляп Л.А., Бобров В.В., Вепринцева О. Д. Информационные системы по фауне позвоночных животных России в глобальной сети Интернет. Сборник материалов конференции “Экология, эволюция и систематика животных”, 2009 г., Изд. НП Голос губернии, Рязань, 2009, с. 19-21.

Петросян В.Г., Назарова К.А., Нагорная Е.Г., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А. Комплексная модель оценки кормовых ресурсов местообитаний и плотности парнокопытных животных России на основе данных наземных и дистанционных измерений. В сб. Математическое моделирование в экологии. 2009 г.- Пущино, ИФХиБПП РАН, С. 203-205

Петросян В.Г., Нухимовская Ю.Д., Омельченко А.В., Бессонов С.А. Комплекс Web-ориентированных информационно-аналитических систем инвентаризации фауны позвоночных животных России и флоры природных государственных заповедников с использованием современных технологий Google Maps Api. Материалы XII Международной научно-практической экологической конференции «Структурно-функциональные изменения в популяциях и сообществах на территориях с разным уровнем антропогенной нагрузки», Белгородский государственный национальный исследовательский университет, г. Белгород, 9-12 октября 2012 г. с. 164-165.

Петросян В.Г., Омельченко А.В., Бессонов С.А., Дергунова Н.Н. Математические модели и базы данных для управления популяциями важнейших ресурсных видов парнокопытных России. Материалы XII Международной научно-практической экологической конференции «Структурно-функциональные изменения в популяциях и сообществах на территориях с разным уровнем антропогенной нагрузки», Белгородский государственный национальный исследовательский университет, г. Белгород, 9-12 октября 2012 г. с. 166-167.

Петросян В.Г., Омельченко А.В., Дергунова Н.Н., Бессонов С.А. Подходы к выбору оптимальной стратегии управления популяциями парнокопытных России. В кн. “Актуальные проблемы экологии и природопользования”. Сборник научных трудов. Изд. РУДН, 2013, С. 219-225

Петросян В.Г., Омельченко А.В., Токарская О.Н., Рысков А.П. Популяционно-генетический анализ кавказских скальных ящериц рода Darevskia // В. кн. «Биологическое разнообразие и проблемы охраны фауны Кавказа», Ереван, Армения. – Ер.: Асогик, 2011. – С. 246-250.

Петросян В.Г., Решетников Ю.С., Нухимовская Ю.Д., Омельченко А.В., Бессонов С.А., Дергунова Н.Н, Хляп Л.А. Web-ориентированная система по фауне и флоре заповедников России. В кн. “Актуальные проблемы экологии и природопользования”. Сборник научных трудов., Изд. РУДН, 2013. с. 33-38

Петросян В.Г., Токарская О.Н., Рысков А.П. Количественные методы анализа генетической структуры популяций на основе данных геномного маркирования. Материалы международной конференции «Молекулярно-генетические основы сохранения биоразнообразия млекопитающих Голарктики». Товарищество научных изданий М. КМК. 2007. с. 175-190

Петросян, Ю.С. Решетников, О. А. Попова, С.А. Бессонов, Н.Н. Дергунова, А.В. Омельченко. Web-ориентированная информационная система и база данных видового разнообразия рыбного населения в заповедниках России. В кн. Современное состояние биоресурсов внутренних водоемов. Материалы докладов I Всероссийской конференции. М.: АКВАРОС, 2011. Т 2. с. 631-641.

Решетников Ю.С., Петросян В.Г., Попова О.А., Бессонов С.А., Дергунова Н.Н. Разнообразие рыб России на сайтах ИПЭЭ РАН. В. кн. “Водные экосистемы: трофические уровни и проблемы поддержания биоразнообразия”, Материалы международной конференции “Водные и наземные экосистемы: проблемы и перспективы исследований”. Вологда, ООО Центр оперативной печати “Коперник”, 2008. с.350-353.

Рысков А.П., Вергун А.А., Гирнык А.Е., Осипов Ф.А., Семенова С.К., Омельченко А.В., Петросян В.Г., Корчагин В.И. Геномика однополых позвоночных − партеногенетических видов ящериц рода Darevskia // Материалы международной конференции «Хромосома 2015». − Новосибирск, 24-28 августа 2015 г. − С. 152−153.

Сафронова Л.Д., Петросян В.Г. Количественная оценка частоты носителей t-гаплотипов в природных популяциях домашних мышей Mus m. Musculus. В. кн. “Организмы, популяции, экосистемы: проблемы и пути сохранения биоразнообразия”. Материалы международной конференции “Водные и наземные экосистемы: проблемы и перспективы исследований”. Вологда, ООО Центр оперативной печати “Коперник”, 2008. с. 85-92.

Сафронова Л.Д., Петросян В.Г. Характер распространения t-гаплотипов в природных популциях домовых мышей Евразии. Сборник материалов конференции “Экология, эволюция и систематика животных”, 2009, Изд. НП Голос губернии, Рязань, 2009, с. 265-267.

Сафронова Л.Д., Потапов С.Г., Петросян В.Г., Милишников А.Н. Выявление филогенетической связи грызунов рода Mus c использованием t-специфичных микросателлитных маркеров ДНК. Материалы международной конференции «Молекулярно-генетические основы сохранения биоразнообразия млекопитающих Голарктики». Товарищество научных изданий М. КМК. 2007. с. 243-249

 

Патенты и авторские свидетельства

 

Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2017612447 Компьютерная программа для анализа и моделирования вторичных структур микросателлитсодержащих локусов геномов — Microsatellite Analyzer V1 / Омельченко А.В., Вергун А.А., Шайнберг Л.И. заявитель и патентообладатель МПГУ. – № 2016664820; дата поступ. 30.12.16; зарегис. 21.02.17

Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2016610517 Лабораторный конвертер № 1 — LabConverterV1 / Омельченко А.В., Вергун А.А., Омельченко Е.В., Лушникова А.А. заявитель и патентообладатель МПГУ. – № 2015661345; дата поступ. 19.11.15; зарегис. 13.01.16;

Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2016610125 Анализ фонда гельминтологических коллекций – Helminthsys / Петросян В.Г., Зиновьева С.В., Филимонова Л.В., Ломакин В.В., Удалова Ж..В., Хасанова О.С., Буторина Н.Н., Геннадиева Т.М., Омельченко А.В., Бессонов С.А.; заявитель и патентообладатель ФГБУН ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. – № 201566087; дата поступ. 11.11.15; зарегис. 11.01.16;

Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2013615297 Генофонд популяций / Омельченко А.В., Вергун А.А. заявитель и патентообладатель МПГУ. – № 2013610830/69; дата поступ. 05.02.13; зарегис. 04.06.13;

Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2012620145 Региональные фауны млекопитающих России: База данных с WEB-ориентированным доступом / Петросян В.Г., Рожнов В.В., Хляп Л.А., Бессонов С.А., Омельченко А.В., Варшавский А.А.; заявитель и патентообладатель ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. – № 2011620925; дата поступ. 01.12.11; зарегис. 31.01.12;

Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2012620144 Генетические и биологические (зоологические и ботанические) коллекции Российской Федерации: База данных с WEB-ориентированным доступом / Павлов Д.С., Петросян В.Г., Дгебуадзе Ю.Ю., Бессонов С.А., Омельченко А.В., Дергунова Н.Н.; заявитель и патентообладатель ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. – № 2011620924; дата поступ. 01.12.11; зарегис. 31.01.12;

Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2011620070 Web-ориентированная информационно-поисковая система по фауне и флоре особо охраняемых природных территорий (запаведников) России / Павлов Д.С., Петросян В.Г., Дгебуадзе Ю.Ю., Рожнов В.В., Бессонов С.А., Решетников Ю.С., Корнеева Т.М., Нухимовская Ю.Д., Дергунова Н.Н., Омельченко А.В. ; заявитель и патентообладатель ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. – № 2010620680; дата поступ. 25.11.10 ; зарегис. 20.01.11;

Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2011620071 Web-ориентированная информационная система и интегрированная база данных по разнообразию позвоночных животных России / Павлов Д.С., Петросян В.Г., Дгебуадзе Ю.Ю., Рожнов В.В., Решетников Ю.С., Павлинов И.Я., Корнеева Т.М., Бессонов С.А., Хляп Л.А., Варшавский А.А., Дорофеева Е.А., Сиделева В.Г., Попова О.А., Бобров В.В., Омельченко А.В., Назаренко Е.А. ; заявитель и патентообладатель ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. – № 2010620687; дата поступ. 30.11.10  ; зарегис. 24.01.11;

Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2011620072 Чужеродные виды млекопитающих в экосистемах России: Web-ориентированная информационно-поисковая система / Петросян В.Г., Дгебуадзе Ю.Ю., Бессонов С.А., Омельченко А.В., Хляп Л.А., Бобров В.В., Варшавский А.А. ; заявитель и патентообладатель ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. – № 2010620688; дата поступ. 30.11.10  ; зарегис. 24.01.11.

 

ПАРТНЕРЫ

Рис. 6.1. Внутри институтские, внутри российские и международные связи Кабинета Биоинформатики и моделирования биологических процессов

 

 

ССЫЛКИ

Российский Журнал Биологических Инвазий (Russian Journal of Biological Invasions) - http://www.sevin.ru/invasjour/

Чужеродные виды на территории России  - http://www.sevin.ru/invasive/

Портал "Генетические и биологические (зоологические и ботанические) коллекции Российской Федерации" - http://www.sevin.ru/collections/

Позвоночные животные России (Информационно-поисковая система) - http://www.sevin.ru/vertebrates/

Информационная поисковая система по фауне и флоре заповедников России - http://www.sevin.ru/natreserves/

Инвазионные виды на территории России (Top 100 worst) - http://www.sevin.ru/Top100worst/

 

Петросян Варос Гарегинович Главный научный сотрудник д.б.н. Старший научный сотрудник    
Омельченко Андрей Владимирович Научный сотрудник к.б.н.          
Дергунова Наталья Николаевна Научный сотрудник        
Горяйнова Зоя Игоревна Младший научный сотрудник      
Озерова Надежда Андреевна Младший научный сотрудник к.г.н.          
Осипов Федор Алексеевич Исполняющий обязанности младшего научного сотрудника