Перейти к основному содержанию

Заголовок
Кабинет биоинформатики и моделирования биологических процессов

О кабинете
Изображение
Эмблема

Кабинет организован в 2001 г.

Основные направления исследований – информационное и программное обеспечение исследований биологических систем, включающие

  • изучение организации и функционирования биологических систем разного уровня на основе методов и средств информатики;
  • разработку методологических подходов для изучения эволюции живой природы на основе количественных методов оценки генетической структуры популяции и филогенетических связей таксонов видового и надвидового уровней;
  • исследование устойчивости экологических систем;
  • компьютерное моделирование процессов получения, накопления, обработки и систематизации данных по биоразнообразию России;
  • создание новых информационных технологий на основе результатов исследований живой природы.

Петросян Варос Гарегинович - основатель и многолетний заведующий кабинетом “Биоинформатики и моделирования биологических процессов”. Кабинет организован в 2001 г.

Ученая степень - доктор биологических наук, кандидат технических наук.

Образование – в 1981 г. закончил Московский физико-технический институт (МФТИ), с 1984 г. – кандидат технических наук (защита диссертации на совете при МФТИ), с 2004 – доктор биологических наук  (защита диссертации д.б.н. на совете при МГУ им. М.В. Ломоносова).

Научные награды, общества

Лауреат международной премии им. Г. Форда (1998 г.) - за разработку интегрированной информационной системы - “Integration of ground truth and spaceborne sensor data with a GIS for coastal zone management of the Turkish Mideterranean coasts”;

Удостоен главной премии по биологии МАИК “Наука/Интерпериодика” за цикл работ, опубликованных в журнале “Генетика” в 2001-2003 гг.;

Заместитель главного редактора "Российского журнала биологических инвазий";

Член международного комитета по созданию информационной системы и базы данных по чужеродным видам северо-европейских и балтийских стран (NOBANIS, North European and Baltic Network on Invasive Alien Species, http://www.nobanis.org). В состав комитета входят представители из 26 стран Евросоюза;

Член российского национального комитета РАН по сбору и оценке численных данных в области науки и техники (КОДАТА);

Член комиссии РАН по сохранению биологического разнообразия, зам. председателя секции информатизация исследований в области биоразнообразия.

Член ученого совета ИПЭЭ РАН,

Член Совета при ИПЭЭ РАН по защите докторских и кандидатских диссертаций.

Член оргкомитета IV международного симпозиума «Чужеродные Виды в Голарктике» (БОРОК – 4), 22 – 28 сентября 2013 г. п. Борок, Ярославская область, Россия.

Член оргкомитета V международного симпозиума «Чужеродные Виды в Голарктике» (БОРОК – 5), 25 – 30 сентября 2017 г. п. Углич, Ярославская область, Россия.

Член оргкомитета "Публикация данных в Глобальной Информационной Системе по Биоразнообразию - GBIF", ИПЭЭ РАН,  GBIF-Дания,  октябрь 16, 2015;

Соорганизатор с российской стороны международной рабочей группы по экологии митотического драйва, Швейцария, г. Цюрих, Университет Цюриха, 21-27 июня 2015 г.

Аккредитован и включен в Федеральный реестр экспертов научно-технической сферы Минобрнауки России (Регистрационный номер № 06 – 01537, от 25 июня 2015 г.);

Включен в список экспертов Российской академии наук (РАН), выдан сертификат эксперта РАН, Идентификационный номер эксперта 2016-01-5643-6268, Распоряжение Президиума РАН от 27.07.2016 № 10108-509;

Член международной экспертной группы, организованной по инициативе GBIF (Global biodiversity Information Facility) (http://www.gbif.org/newsroom/news/invasive-alien-species-task-group-launched, 6 июня 2016 г., Дания) с целью оценки пригодности данных и улучшения функциональных возможностей GBIF для сбора и хранения информации по чужеродным и инвазионным видам на глобальном, континентальном, региональном и национальном уровнях.

Международные визиты и сотрудничество:

        США -Fish and Wildlife Service, USA (1991-1992; a два месяца  каждый год)

        США - University of Alaska Fairbanks, Juneau, Alaska, USA  (1993-1994; два месяца каждый год)

        США - USGS , Anchorage, Alaska, USA 1997 – три месяца)

      Турция- Istanbul, Technical University, Turkey (1997, 2 месяца)

        Италия- Italian National Academe of Science, Rome (2002, 1 месяц );

        Дания - Copenhagen, Denmark, NOBANIS meeting (2006, 2 месяца  );

        Италия - Siena, Italy Zoological congress (2007, 2 две недели );

        Франция - Paris, France International symposium (2008, две недели );

        Дания  - Copenhagen, Denmark, GBIF meeting (2009, две недели );

Польша -7th International Moose Symposium, Mammal Research Institute of the Polish Academy of Sciences (2012- две недели)

Хорватия - 6th International Beaver Symposium. Faculty of forestry, University of Zagreb, Croatia (2012- две недели);

Республика Армения - II Международная научная конференция “Биологическое разнообразие и проблемы охраны фауны Кавказа” Ереван, Республика Армения, 23 - 26 сентября 2014 г;

Республика Беларусь -  Международная Научно-Практическая Конференция "Современные технологии в деятельности ООПТ" (ГИС-Нарочь_2014), Минск-Нарочь, 12–16 мая 2014 г.

Швейцария – WorkShop “Ecology of meiotic drive”(21- 27 июня, 2015г.);

Кипр - 9th Symposium on the Lacertids of the Mediterranean Basin & 1st Symposium on Mediterranean Lizards (Limassol, Cyprus), 20-23 June, 2016;

Люксембург – NEOBIOTA 2016. Biological Invasions: Interactions with Environmental Change 9th International Conference on Biological Invasions Vianden, Luxembourg.14-18 September 2016;

Германия – WorkShop “Strategic approaches and interventions for improving data fitness for use for A&IS”. GBIF Task Group on Data Fitness for use in Research on Invasive Alien Species, German Centre for Integrative Biodiversity Research, Leipzig, Germany, 9-11 July 2016

Австралия – WorkShop “Top priorities and key recommendations for improving the data fitness for use for alien and invasive species”. GBIF Task Group on Data Fitness for use in Research on Invasive Alien Species, School of Biological Sciences at the Monash University, Clayton, Melbourne, Australia, 8-14 October 2016;

Польша – WorkShop, University of Biatystok and Polish National Academy of Science "Mechanisms affecting the transfer of matter and energy from phytoplankton to zooplankton in freshwater ecosystems", 10 June -25 June, 2017.

Руководство (участие) в Российских и международных программах (грантах)

1.Гранты РФФИ  в период - 1996 -2009 гг.:

96-04-49409-а, 98-04-48799-а, 01-04-48388-а, 01-04-49850-а, 01-04-96006-р2001центр, 02-04-48516-а, 02-04-49946-а, 02-04-63143-к, 03-04-96314-р2003центр_а, 04-04-49436-а, 06-04-96302-р_центр_а, № 09-04-91331-ННИО_а;

Грант Службы рыбы и дичи, США (Программа V «Охрана природы и организации заповедников» в рамках Российско-Американского соглашения об охране окружающей среды и природных ресурсов). -№ 98210-5-G249 Создание WEB-ориентированной информационно-поисковой системы по фауне и флоре заповедников России”, 2006-2007гг;

Грант РФФИ 08-04-00668-а по теме “Молекулярная природа аллельного полиморфизма микросателлитных локусов у партеногенетических ящериц рода Darevskia”; Сроки выполнения 2008-2010, Исполнитель

Проекты и гранты за последние 5 лет:

1. Грант РФФИ № 11-04-00754-а по теме “Геномный полиморфизм и генетическое разнообразие партеновидов рода Darevskia”; Сроки выполнения 20011-2013 гг., Исполнитель;

2. Грант РФФИ № 12-04-90859-мол_рф_нр по теме “Изучение влияния речного бобра (Castor fiber L.) на экосистемы особо охраняемых природных территорий РФ с использованием информационных технологий”. Сроки выполнения 2012 г.; Руководитель;

3. Грант РФФИ №  15-04-06423. “Экологические последствия восстановления численности речного бобра (Castor fiber L.) в субоптимальных и пессимальных местообитаниях экосистем малых рек на примере особо охраняемых природных территорий Европейской части России”, сроки выполнения 2015-2017; Руководитель;

4. Грант РФФИ № Офи_м  15-29-02528 “Инвентаризация коллекции паразитических червей Гельминтологического музея ИПЭЭ РАН и создание WEB–ориентированной информационно-поисковой системы в целях интеграции междисциплинарных исследований по систематике, морфологии, зоогеографии и эволюции этих организмов.”, 2015-2017; Исполнитель;

5. Грант РФФИ Офи_м 15-29-02550  “Исследование инвазий чужеродных видов организмов, представляющих наибольшую опасность для экосистем Европейской части России: пути распространения, векторы, биологические особенности и методы контроля”, 2015-2017; Исполнитель;

6. Программа фундаментальных исследований Отделения биологических наук РАН - «Биологические ресурсы России: оценка состояния и фундаментальные основы мониторинга», тема-“Создание комплекса имитационных моделей для оценки динамических трендов ресурсных популяций парнокопытных на основе многолетних данных наземного мониторинга и космических измерений”; Cроки выполнения 2009-2011 гг; Руководитель;

7. Программы фундаментальных исследований Президиума РАН «Биологическое разнообразие», тема – “Информационное обеспечение инвентаризации фауны позвоночных животных России (включая особо-охраняемые природные территории)”- Сроки выполнения 2009-2011 гг.; Руководитель;

8. Федеральная целевая Программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы, Шифр «2012-1.1-12-000-1001-064», Соглашение от 20 июля 2012 г. № 8051, «Разработка технологий оценки рисков и экологических способов контроля инвазий чужеродных видов организмов на территорию Европейской части России», Сроки выполнения 2012-2013; Ответственный исполнитель;

9. Федеральная целевая Программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы, Шифр «2010-1.1-234-069-065», Государственный контракт от 28 июня 2010 г. № 02.740.11.0867, «Создание базы данных по биологическим инвазиям чужеродных видов и другим формам антропогенного воздействия на экосистемы Волжско-каспийского бассейна; разработка научных основ предупреждения и экологических способов контроля таких воздействий», Сроки выполнения 2010-2012; Ответственный исполнитель;

10. Федеральная целевая Программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы, Шифр «2010-1.1-220-142-050», Государственный контракт от 20 сентября 2010 г. № 14.740.11.0410, «Комплексный мониторинг параметров океана и атмосферы для оценки динамики таяния арктических льдов и влияния изменений климата на арктические экосистемы», Сроки выполнения 2010-2012, Ответственный исполнитель;

11. Программа Призидума РАН. «Живая Природа: Современное состояние и проблемы развития», “Разработка и усовершенствование комплекса WEB-ориентированных информационно – аналитических систем инвентаризации фауны позвоночных животных России и флоры природных государственных заповедников (ООПТ) с использованием современных технологий Google Maps API”; Сроки выполнения 2012-2014; Руководитель;

12. Программа фундаментальных исследований. Отделения биологических наук. «Биологические Ресурсы России: Динамика в условиях глобальных климатических и антропогенных воздействий», «Математические модели и базы данных для управления популяциями важнейших ресурсных видов парнокопытных России и разработка практических рекомендаций по нормированию использования ресурсов охотничьих животных», сроки выполнения 2012-2014; Руководитель;

13. Биологическая инвазия чужеродных видов организмов в наземные и водные экосистемы в условиях глобальных климатических и антропогенных воздействий, грант Российского научного фонда, сроки выполнения 2016-2018, руководитель;

14. Грант РФФИ  № 17-04-00396 Происхождение и формирование клонального разнообразия у однополых (партеногенетических) видов ящериц рода Darevskia, 2017-2019 г., исполнитель

Экспертная деятельность

Рецензирование с 2012 по 2017 гг более 40 статей, изданных в отечественных и международных журналах – Российский журнал биологических инвазий, Доклады РАН, Известия РАН серия биологическая, Генетика, Успехи современной биологии, Ecology and Evolution, Arctic research, Springer Plus, PLoS ONE, Biological Invasion, Gen Genet, Journal of Heredity и др.

Экспертиза заявок и отчетных материалов - 32 в 2007 г.,  20 в 2008 г.,  12 в 2009 г., 6 в 2010 г., 29 в 2011 г., 24 в 2012 г., 8 в 2013г; проводимых в рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»», организатор конкурса Министерство образования и науки РФ (тематики экспертизы– биоинформатика, информационные системы, базы данных, математическое моделирование, биологическая инвазия);

Экспертиза заявок  и отчетных материалов - 14 в 2014 г., 14 в 2015 г., 17 в 2016 г., 8 в 2017 г., проводимых по Фонду информационного обеспечения науки (ФИОН) в рамках мероприятий Программы "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы" (тематики экспертизы - биоинформатика, информационные системы, базы данных, математическое моделирование, биологическая инвазия).

Экспертиза 3 проектов 2008-2010 гг. в рамках “Международных Программах РФФИ с фондами других стран в области биоинформатики и применения информационной технологии в биологии и экологии;

Экспертиза “Проекта нормативов допустимого остаточного содержания нефти (ДОСН) в донных отложениях водных объектов автономного округа для оценки качества проведения восстановительных работ (по очистке дна)”, представленного в рамках выполнения работ по Государственным контрактам № 187 и 188 (от 28 ноября 2011 г.) целевой программы ХМАО-Югры «Обеспечение экологической безопасности ХМАО-Югры в 2011-2113 г»;

Экспертиза 3 заявок Российского научного фонда в 2015 г. (тематики - динамика популяций и сообществ гидробионтов, система комплексного мониторинга почв, популяций сельскохозяйственных животных и растений, полногеномный анализ ассоциаций по локусам количественных признаков);

Экспертиза 3 заявок Российского научного фонда в 2016 г. (тематика – трансформации биоценозов при инвазии/интродукции чужеродных видов; эволюция взаимных адаптаций в системе при вселении чужеродных видов, мониторинг влияния климатических изменений на уязвимые экосистемы);

Экспертиза 7 заявок Российского научного фонда в 2017 г. (тематика – инновационные принципы и методы информационно-измерительных систем; анализ методик статистической обработки прямых и дистанционных данных в земледелии, оценки эффективности применения беспилотного автономного комплекса в экологии, обезвреживание и утилизация загрязнителей оз. Байкал и его водосборного бассейна, климатогенная динамика древесной растительности и ее влияние на изменение запасов углерода на локальном и региональном уровнях, мониторинг расширения ареалов южных видов членистоногих; моделирование сценариев инвазии моллюсков в Западной Сибири);

Экспертиза 4 научных результатов в 2017г, полученных за счет средств федерального бюджета и проводимых в рамках экспертной системы РАН (тематика - математическое моделирование и прогнозирование состояний и процессов комплексной безопасности городской среды; биотические компоненты экосистем, их свойства, ресурсный потенциал и динамика в условиях трансформации природной среды).